Rédiger les matériels et méthodes de larticle scientifique
Les matériels et méthodes expliquent comment vous avez mené votre expérience Après lecture de la section Matériels et méthodes (Materials and Methods, Experimental, Experimental Procedures, Methods, etc ), le chercheur de votre spécialité doit être apte à reproduire l’expérience et à critiquer la validité des résultats
Matériel et méthodes
10x, 100µL de NaOH et 600µL de collagène I (4 mg/mL, dans AcOH 17 mM), puis différents volumes d’EDC (20 mg/mL, dissous dans l’eau) et NHS (80 mg/mL, dissous dans l’eau) La quantité de CS, d’EDC et de NHS varie suivant différents ratios, cf tableau ci-dessous Le tout est mélangé à l’aide d’une micropipette
Partie B : Matériels et méthodes
Partie B : Matériels et méthodes Cette deuxième partie permet de définir les caractéristiques physiques et anthropiques des bassins de l’étang de Thau et de l’étang de l’Or Sur ces deux sites d’étude, on précise les données accessibles dans l’optique d’une modélisation des flux d’azote (chapitre B1)
Liste matériel nécessaire (mai 2018)
et destiné à des élèves en difficulté pour différencier Les fournisseurs proposés sont totalement indicatifs et n’ont aucun but publicitaire Il s’agit juste de vous éviter des recherches Vous pouvez vous fournir n’importe où Description Description Quantité (à minima) Niveaux Matériel de numération en base 10 (cubes
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Partie B : Matériels et méthodes
Cette deuxième partie permet de définir les caractéristiques physiques et anthropiques des bassins de l'étang de Thau et de l'étang de l'Or. Sur ces deux sites d'étude, on précise les données accessibles dans l'optique d'une modélisation des flux d'azote (chapitre B1). Les bassins du Pallas et de la Vène (situés sur le bassin de l'étang de Thau) et les bassins du Salaison et du Dardaillon (bassin de l'étang de l'Or) sont retenus pour développer le modèle d'exportation d'azote. Ces quatre bassins ont fait l'objet d'un suivi des débits et des concentrations nécessaire au calage d'un modèle d'exportation d'azote. Le chapitre B2 permet de préciser les caractéristiques de ces quatre bassins et d'analyser la dynamique des flux d'azote. Il ressort de cette analyse qu'aucun modèle de flux existant n'est adapté aux spécificités des bassins en terme de dynamique des flux d'azote, de prise en compte des activités anthropiques et de données accessibles. Un modèle original d'exportation d'azote dénommé POL, est donc proposé dans le chapitre B3 pour répondre aux contraintes opérationnelles retenues en introduction de ce mémoire. Les différentes hypothèses sur lesquelles repose le modèle sont décrites et justifiées. Chapitre B1 : Données disponibles sur la zone d'étude B1 : Données disponibles sur la zone d'étude 55B1. Données disponibles sur la zone d'étude
Utiliser ou concevoir un modèle d'exportation d'azote nécessite un minimum de données concernant : les variables de forçage dont la pluie qui joue le rôle de moteur dans la production et le transport des flux d'azote depuis les versants jusqu'à l'exutoire ; la variable de sortie du système, à savoir : le flux d'azote (qui nécessite des mesures de débit et de concentration en azote) ; les variables d'entrée en terme de masses d'azote (apports agricoles, rejets de stations d'épuration, ...) ; les caractéristiques physiques des bassins (occupation du sol, géométrie du réseau hydrographique, etc ...). L'analyse des données accessibles est une étape indispensable qui va conditionner le choix du modèle adapté aux bassins d'étude et aux objectifs de modélisation. Le travail de modélisation des exportations d'azote porte sur les bassins versants de l'étang de l'Or et de l'étang de Thau localisés dans le département de l'Hérault. L'étang de Thau représente une surface de 7500 ha pour une profondeur moyenne de 4 m. La superficie de son bassin versant est de 269 km². L'activité principale sur l'étang est la conchyliculture. L'étang de l'Or occupe 3170 ha pour une profondeur moyenne de 0.8 m. La principale activité est la pêche. Son bassin versant représente une superficie de 348 km².L'ensemble des données cartographiques sur la zone d'étude a été harmonisé (système de
projection, cohérence entre informations) pour concevoir un SIRS (Système d'Information àRéférences Spatiales). Les différentes couches d'information du SIRS sont présentées dans
l'annexe 3C.Partie B : Matériels et méthodes
56B1-1. Caractéristiques physiques des bassins
B1-11. Topographie
L'étude hydrologique d'un bassin versant nécessite la prise en compte de la topographie qui conditionne, pour une large part, le cheminement de l'eau, sa dynamique ainsi que le typed'écoulement. Le modèle numérique de terrain (MNT) constitue une représentation numérique
de l'altimétrie. L'analyse des données contenues dans un MNT, ainsi que ses informationsdérivées, comme la pente, les directions d'écoulement, les limites et surface de bassin versant
et la géométrie du réseau hydrographique permettent de caractériser la topographie et la morphologie associée d'une zone donnée (MOORE et al., 1993). Le MNT de la base Bd Alti de l'IGN permet de décrire la topographie sur la totalité de lazone d'étude. Ce MNT est obtenu a été conçu par interpolation entre des points cotés de la
Bd Alti. La résolution du MNT est de 50 m et sa précision sur la zone étudiée est de 1 à 3 m
en altitude. La qualité des données disponibles est seulement estimée sur le plan des altitudes
et ne garantit en rien la qualité des plans dérivés (en particulier l'extraction des rivières
(PUECH, 2000)). Le MNT disponible sur la zone va être utilisé pour décrire la topographie de la zone et extraire les limites des bassins versants et les directions d'écoulements. L'annexe 2C illustresur les bassins d'étude la méthode de correction du MNT utilisée pour améliorer la qualité des
réseaux hydrographiques extraits (CHARLEUX-DEMARGNE, 2001). L'analyse du MNT permet de caractériser la topographie des deux bassins (cf. Fig. B1-1). Les différentes rivières figurées sur la figure B1-1 proviennent de la base Bd Carto de l'IGN. L'analyse du MNT permet de préciser le topographie des deux bassins versants. Sur le bassinde l'étang de Thau, le relief est caractérisé par deux massifs principaux : le Causse d'Aumelas,
point culminant du bassin (322 m) et le massif de la Gardiole au Nord Est de Sète. Sur le reste du bassin, le relief est plus monotone. Une dizaine de rivières draine le bassin avec unedirection privilégiée du Nord au Sud. Les rivières les plus importantes sont le Pallas au centre
du bassin et la Vène à l'extrémité Est. La longueur totale du réseau hydrographique s'élève à
157 km dont seulement 64 km sont considérés comme pérennes.
Le bassin versant de l'Or culmine au Nord à 317 m. Le centre et la partie aval du bassinprésente un relief monotone caractérisé par une faible pente. Le bassin est entièrement situé
dans le département de l'Hérault à l'exception d'une portion de la commune d'Aigues-Mortes dans le Gard. Une dizaine de rivières draine le bassin du Nord au Sud vers la lagune. Les plus importantes sont le Salaison et le Dardaillon. On recense 237 km de rivières dont seulement la moitié est considérée comme pérenne. B1 : Données disponibles sur la zone d'étude57 Las caractéristiques topographiques des bassins de l'Or et de Thau sont illustrées sur la figure
B1-1. Figure B1-1 : Localisation et topographie des deux sites d'étude0 10 km
Mèze
Marseillan
Sète
Mer Méditerranée Etang
de ThauSources : BD Alti et BD Carto de l'IGN
01 - 50
50 - 100
100 - 150
150 - 200
200 - 250
250 - 300
> 300Rivières
Limites du bassin
versantEtang de l'Or
Mer Méditerranée
La Grande Motte Montpellier
Légende
Altitude (m)
0 10 kmBV = 348 km²
BV = 269 km²
LeSalaison Le
Dardaillon
La Vène
Le Pallas
Partie B : Matériels et méthodes
58B1-12. Contexte hydrogéologique
L'analyse préalable des données hydrogéologiques est indispensable pour déterminer la pertinence des limites topographiques du bassin versant. La présence de zones karstiques peut augmenter le bassin d'alimentation en eau d'une rivière (KACAROGLU, 1999, PLAGNES etBAKALOWICZ, 2001).
Deux sources d'informations sont disponibles sur les deux zones d'études : les limites et nature des aquifères du Languedoc-Roussillon représentées au 1/250 000 ième(Agence Rhône Méditérranéen Corse - BRGM) au format numérique illustrées ci-contre ;
la Carte hydrogéologique du Languedoc et du Roussillon au format papier réalisée en1978 par E. GOACHET qui intègre les travaux du Centre d'Etude et de Recherches
Hydrogéologiques menés depuis 1958. Cette information a été numérisée pour être intégrée au SIRS. Du point de vue hydrogéologique, les deux bassins d'étude sont très différents comme l'illustre la figure B1-2. Le bassin de l'Or présente deux faciès distincts (DIREN, 1998) : au nord, le bassin est représenté par des terrains calcaires, marneux et molassiques du crétacé et du tertiaire ; au sud, des formations villafranchiennes (sables, molasse, argiles et galets) recouvrent la plaine de Mauguio-Lunel (DIOP, 1980). La nappe localisée au sein des formations villafranchiennes fait l'objet d'une surveillance de la qualité de l'eau car l'ensemble du périmètre est classé en zone vulnérable (MAILLET, 1995).Sur le bassin de Thau, deux sous-ensembles peuvent être distingués (Contrat pour l'étang de
Thau, 1997) :
une zone calcaire à pente plutôt forte (à l'Est du bassin). La contribution du karst sur les
écoulements superficiels de la Vène est importante puisque le bassin d'alimentation représente le double du bassin topographique ; une zone de faible pente sur substrat marneux à marno-argileux (au centre et à l'Ouest du bassin). Du point de vue hydrologique, la nature marneuse des sols va induire un temps deréponse très court des ruisseaux aux épisodes pluvieux de fortes intensités. Par contre, du
fait de la faible pente de ces zones, les épisodes pluvieux d'intensité limitée n'engendreront qu'un faible ruissellement superficiel.L'analyse de ces deux types d'information a permis de conserver le tracé du bassin déterminé
par la topographie pour le bassin de l'Or. Sur le bassin de Thau, une composante karstique doit être prise en compte. Le bassin versant d'alimentation est donc plus étendu que le seul bassin topographique. B1 : Données disponibles sur la zone d'étude 59Figure B1-2 : Contexte hydrogéologique des deux sites d'étude
B1-13. Pédologie
Le sol est le siège de nombreux processus intervenant dans le cycle de l'eau et celui de l'azote. La prise en compte de la pédologie comme variable descriptive du bassin dépend du degré de simplification des processus du cycle de l'eau et de l'azote et est fortement dépendante de la disponibilité de la donnée (SAULNIER, 1996). Deux types différents de données pédologiques sont disponibles sur les bassins d'étude : des cartes pédologiques sur support papier depuis le 1/5 000 ième et 1/100 000 ième existent uniquement sur des portions des bassins. De même, des profils de sols réalisés ponctuellement dans le cadre d'études agronomiques sont disponibles (ROUZET, 1992) ; une carte numérique des pédopaysages réalisée par l'INRA sur l'ensemble de Languedoc-Roussillon au 1/250 000
ième recouvre la totalité des sites d'étude.Légende
Formations géologiques
Alluvions
Calcaires
Marnes, sables, molasses, calcaires
Calcaires et marnes
Source BRGM
Etang de
Thau Etang de
l'Or Bassin d'alimentation karstique0 10 km
Limites du bassin
topographique Limites du bassin topographiquePartie B : Matériels et méthodes
60B1-14. Occupation du sol
La connaissance, sur chaque bassin, de l'occupation du sol est nécessaire pour déterminer la répartition des apports d'azote dans l'espace et le temps. Plusieurs sources d'informationpermettent de caractériser l'occupation du sol sur un périmètre donné selon la précision
souhaitée, le budget et la surface à renseigner. On distingue ainsi la détermination directe sur
le terrain, les photos aériennes, et les images satellitales (GIRARD et GIRARD, 1999).Nous avons retenu les images satellitales adaptées à la surface des deux sites d'étude. Sur le
bassin de Thau, nous utilisons une cartographie préexistante réalisée en 1999 sur des images
SPOT de 1996 (SAGOT, 1999). Nous estimons que la dynamique de l'occupation du sol sur ce bassin permet d'utiliser cette information sur la période 1994 - 1998 (période de mesure deflux d'azote sur l'étang de Thau). Sur le bassin de l'Or, l'urbanisation intense nous a conduit à
réactualiser l'occupation du sol à partir d'images satellitales SPOT acquises en 2000 (DAURIAC, 2000). Une description des nomenclatures et de la qualité de la classification pour ces deux travaux est synthétisée dans l'annexe 3A. Du point de vue de l'occupation des sols, les deux bassins présentent des faciès différentsquotesdbs_dbs47.pdfusesText_47