[PDF] Diversité et dynamique des variétés locales de riz (O. Sativa et O

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ACADEMIEDERENNES

ENSADERENNES

THESE présentéedevant POUR

OBTENIRLETITREDEDOCTEURDEL'ENSAR

par

BARRYMamadouBillo

DERIZ(O.SATIVA&O.GLABERRIMA)ENGlTINEE

CONSÉQUENCES

POURLACONSERVATION

DESRESSOURCESGÉNÉTIQUES

N°2006-24

SerieA-48

Soutenuepubliquementle 28septembre2006devantlejurycomposéde :

AlainGHESQUIERE,HDR,

!RDMontpellier

PhilippeBRABANT,HDR,INA-PGParis

JoëlleRONFORT,

HDR,INRAMauguio

Jean-Marc

BARBIER,INRAMontpellier

NourollahAHMADI,

CIRAnMontpellierPrésident

Directeurdethèse

Rapporteur

Rapporteur

Examinateur

Co-directeurdethèse

TABLEDESMATIERES

!N1RODUCTION9 .............................Il .............Il

1.1.2Conservationinsitu12

..................................15

1.3.2Sélection15

1.3.3Migration17

2Leriz18

2.1LerizenAfrique18

2.2LerizenGuinée19

2.2.1Lestypesderiziculture20

letenne"variété"288

3Objectifdelathèse29

ASSESS

INSITUVARIETALDIVERSITYINCROPPLANT31

Introduction32

1.Matérielsetméthodes34

1.3.Analysedesdonnées34

2.Résultats38

2.1.Larichessevariétalevillageoise38

2.3.Tauxd'utilisationdesvariétés38

3.Discussion42

VARIETESDERIZCULTIVEESENGUINEEMARITIME48

Introduction48

1-Sitesd'étudeetméthodologie49

1.1LaGuinéemaritime49

1.2Echellesd'études

etchoixdessitesd'enquêtes50

1.3.1Donnéessociodémographiques53

1.4Méthodesd'enquête55

2-Résultats58

2

2.2.1Lesdeuxespècescultivées58

3-Discussion78

3.2Importancerelativedesvariétés79

Introduction85

1.Materialsandmethods85

1.1Plantcollection85

1.2Genotyping88

1.3Phenotyping88

1.4Dataanalysis88

2.Results88

2.1Extentofthegeneticdiversity88

2.2Genotypicdiversity92

2.3Phenotypicdiversity92

3.Discussion93

CHAPIIREV :IMPLICATIONSFORINSITUGENETICRESOURCECONSERVATIONFROM1RE

Introduction99

1.Materialandmethods102

1. 1.Plantcollection102

1.2.Genotyping102

1.3.Dataanalysis102

2.Results104

2.1.Consistencyofnameofaccessions104

2.2.Geneticdiversity105

3.Discussion107

3.1.Importanceofricegeneticdiversity107

3.2.Varietaldiversitymanagedbyfarmers107

PARLESMARQUEURSSSR112

Introduction113

1.Matérieletméthode115

1.2.Choixdesexploitations115

1.4.Caractérisationdeladiversité génétique116

3

2.Résultats119

119

2.3.1.Etendue

2 32
D 'ffi'.." .l',1"123 . . . 1erenclatlOngenetlqueleeauxexpOltatIons..

3.Discussion125

ETLESMARQUEURSMOLECULAIRES132

Introduction

132

1.Matérielsetméthodes133

1.1.PériodesetSitesd'étude133

133

1.3.Matérielvégétal134

1.4.Génotypage

135

1.5.Analysedesdonnées135

2.Résultats137

3.Discussion141

recensées" 141

Conclusion142

DISCUSSIONGÉNÉRALEETCONCLUSION146

1.Rappeldesprincipauxrésultats146

148

2.1Pourquoiconserver?149

2.2Quellediversitéconserver?149

2.3Commentconserver?150

2.4Conservationexsitu150

2.5Conservationàlaferme

151

2.5.2Sélectiondessites153

BIBLIOGRAPHIE159

Annexes164

4

REMERCIEMENTS

Sékou

pourm'avoir acceptédansle encouragement. l'ADRAOpourleursoutien financierqui

Montpellier.

qu'iltrouveici mareconnaissanceetmesvifsremerciements.

JeremercieinfinimentJean-Louis

aidé

COURTOIS

desdonnées. l'ADRAOpourleur collaboration

SOGBOSSI.

etPhilippe

BRABANT

Jetiensàremercier

lapluie multiplesinterviews

Merciàtousmescollèguesetamisde

Jeleurexprimemaprofondesympathie

etleursouhaitebeaucoupdebien.

Atousceuxqui,deprès

remerciements. 5 lastationdeKobaetquin'apaspu,

Enfin,

dûsouffiir 6

LISTEDESABREVIATIONS

ADRAO AFLP AMOVA ANOVA BCEPA

BIOTROP

CBSS CIRAD CA Cap CK DM

DYNAFIV

FAO FG FWLL MG DG LG Na NKDV NCDV IBPGR IPGRI IDES SA lITA IRAG IRAT !RD IRRI LPDA

NERICA

ONADER

ORSTOM

ORS PAG

PDRIGM

SG2000

SMIAR SNPRV SNRA ONG LLE LPDA2 PASAL

PDRlGM

PPVA

AmplifiedFragmentLengthPolymorphism

AnalysedeVariance

Community

BasedSeedSystem

Centre

Développement

CulturesAnnuelles

CorrespondenceAnalysisphenotypic

CentredeKilissi

Dikedmangroverice

DynamisationdelaFilièreVivrière

Organisationmondiale

pourl'Alimentationetl'Agriculture

GuinéeForestière

Fresh waterlowland

MoyenneGuinée

HauteGuinée

BasseGuinée

Nombremoyend'allèlesparlocus

Numberofknowndistinctvarieties

Numberofcultivateddistinctvarieties

International

BoardforPlantGeneticResources

InstitutdesSavanes(Côted'Ivoire)

Institut

derechercheagronomiquedeGuinée

Institut

InstitutdeRecherche

pourleDéveloppement

International

RiceResearchInstitute

Lettre

depolitiquededéveloppementagricole

NewriceforAfrica

Officenationale

deDéveloppementdelaRiziculture

OfficedlarechercheScientifique

etTechniqueOutreMer

OpérationRizSiguiri

ProjetAgricoleGueckédou

Sassakawaglobal2000

SystèmeMondiald'Information

etd'Alerte

Servicenational

delapromotionruraleetdelaVulgarisation

ServiceNationaldeRechercheAgronomique

Organisation

NonGouvernementale

Lowlandecosystem

Lettre

Projet

ProjetPilote

deVulgarisationAgricole 7 RUL

UMRDGPC

UMRPIA

ULE UR UDM VEI VEP WARDA

Rainfeduplandriceinslashandbumsystem

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