[PDF] Écologie microbienne en milieu aquatique : des virus aux protozoaires

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Tous droits r€serv€s Revue des sciences de l'eau, 1998 Ce document est prot€g€ par la loi sur le droit d'auteur. L'utilisation des d'utilisation que vous pouvez consulter en ligne. l'Universit€ de Montr€al, l'Universit€ Laval et l'Universit€ du Qu€bec " Montr€al. Il a pour mission la promotion et la valorisation de la recherche.

https://www.erudit.org/fr/Document g€n€r€ le 25 oct. 2023 04:45Revue des sciences de l'eauJournal of Water Science

€cologie microbienne en milieu aquatique : des virus aux protozoairesMicrobial ecology in aquatic systems: a review from viruses toprotozoa C. Amblard, J. C. Boisson, G. Bourdier, D. Fontvieille, X. Gayte et T. Sime-Ngando Amblard, C., Boisson, J. C., Bourdier, G., Fontvieille, D., Gayte, X. & aux protozoaires. Revue des sciences de l'eau / Journal of Water Science 11

145...162. https://doi.org/10.7202/705336ar

R€sum€ de l'article

Par leur abondance et leur diversit€ taxonomique et fonctionnelle, les microorganismes jouent un r†le pr€pond€rant dans les flux de mati‡re et d'€nergie au sein des €cosyst‡mes aquatiques.

Au cours de ces derni‡res ann€es, les progr‡s r€alis€s au niveau des techniques

d'identification, de d€nombrement et de mesure d'activit€ m€tabolique, notamment en microscopie " €pifluorescence et en biologie mol€culaire, ont permis d'entrevoir l'extraordinaire diversit€ des microorganismes aquatiques, l'€tendue de leurs conditions de vie et leurs abondances jusqu'alors largement sous-estim€es. De plus, l'am€lioration sensible des m€thodes s€paratives a permis de d€crire, in situ, la composition biochimique des communaut€s et d'aborder les transferts de mati‡re sous un angle qualitatif. L'ensemble des r€sultats disponibles laisse apparaˆtre que les relations trophiques entre les microorganismes forment un v€ritable r€seau " l'int€rieur duquel la boucle microbienne permet le transfert, au moins en partie, de la production picoplanctonique vers les niveaux trophiques sup€rieurs. Ainsi, des

progr‡s cons€quents ont €t€ r€alis€s quant " la compr€hension du r†le des

communaut€s bact€riennes dans les flux de mati‡re, y compris au niveau d'environnements particuliers (biofilms, milieux extr‰mes). Par ailleurs, alors qu'il a €t€ longtemps admis que la r€gulation des communaut€s bact€riennes €tait essentiellement li€e " la disponibilit€ ou " la qualit€ des substrats organiques, il apparaˆt maintenant que la limitation par les €l€ments nutritifs min€raux, la pr€dation des protistes phagotrophes et du m€tazooplancton et la lyse virale sont €galement des facteurs susceptibles d'intervenir significativement dans ce contr†le. Malgr€ ces progr‡s consid€rables dans le domaine de l'€cologie microbienne, pr‡s de 90% des microorganismes pr€sents dans l'environnement n'ont pas encore €t€ d€crits et la compr€hension des relations entre les microorganismes et le fonctionnement des €cosyst‡mes restent un enjeu majeur pour les ann€es " venir. REVUE DES SCIENCES DE L'EAU, Rev. Sci. Eau n" spécial (1998) 145-162

Écologi

e microbienn e e n milie u aquatiqu e de s viru s au x protozoaire s

Microbia

l ecolog y i n aquati c

Systems

: a review from viruses to protozoa C AMBLARD1*, J.C. BOISSON2, G. BOURDIER1, D. FONTVIEILLE3, X. GAYTE3, T . SIME-NGANDO1

SUMMAR

Y

Récen

t advancement s i n th e ecolog y o f aquati c microbia l comntunities Le. fro m viruse s t o protozoa ar e summarize d i n thi s paper Th e abundanc e an d bot h taxonomi c an d functîona l diversitie s o f microorganism s i n th e se a an d i n inlan d water s indicat e tha t microbe s pla y a ke y rôl e i n nutrien t cyclin g an d energ y flows i n aquati c ecosystems I n récen t years aquati c microbiolog y ha s indee d undergon e profoun d change s du e t o th e improvemen t o f method s fo r identifying counting an d essayin g biochemica l compositio n an d ntetaboli c activitie s o f aquati c microbia l assemblages

Specifically

th e impac t o f ne w development s i n mîcroscop y (e.g. epifluorescence immunofluorescence... an d i n cel l an d molecula r biolog y haquotesdbs_dbs1.pdfusesText_1

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