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Agent pathogène : bactérie virus ou autre micro?organisme tel qu'un parasite ou un champignon pouvant provoquer une maladie Endémique : régulièrement
Quels sont les différents agents pathogènes ?
Il peut s'agir de micro-organismes, comme les bactéries, les virus, les champignons et les protozoaires, ou d'autres organismes, tels que les parasites, les vers et même certaines protéines infectieuses qu'on appelle les «prions».Quelles sont les caractéristiques des différents groupes d'agents pathogènes ?
A : agent biologique pathogène qui peut avoir des effets alllergisants. T : agent biologique qui est susceptible de produire des toxines. V : un vaccin efficace est disponible. spp : cette mention (species) signifie qu'il est fait référence aux autres esp?s qui sont connues pour être pathogènes chez l'homme.Quels sont les agents pathogènes à l'origine des maladies infectieuses ?
Les maladies infectieuses regroupent toutes les maladies provoquées par la transmission d'un agent pathogène tel que les bactéries, les virus, les parasites, les prions et les champignons.- Les principales bactéries pathogènes dans les denrées alimentaires sont les Campylobacter et les salmonelles. Mais les Listeria dans le fromage et les bactéries Escherichia coli entérohémorragiques (ECEH) dans les jeunes pousses ont elles aussi fait les gros titres ces dernières années.
LES AGENTS INFECTIEUX
CLASSIFICATION
INTRODUCTION
On distingue 5 types d'agents infectieux :
• Les bactéries • Les virus • Les parasites • Les champignons • Les prions=agents infectieux non conventionnels.
Les bactéries
LES BACTERIES SONT DES ORGANISMES DIFFERENTS DES VIRUS • Bactéries : procaryotes, pas de " vrai » noyau• BACTERIES VIRUS Grandeur 1µm environ 100fois plus petit Acides nucleiques: ADN + ARN ADN ou ARN Multiplication par scissiparité multiplication par toutes les 20 min une cellule hôte
STRUCTURE D' UNE BACTERIE
Membrane plasmique
barrière sélective double couche lipidique protéines enchâssées (contrôle flux d 'entrée et de
sortie de la cellule) mosaïque fluidePAROI DES GRAM +
Paroi Peptidoglycane (Rôle dans la pathogénie)PAROI DES GRAM-
Peptidoglycane Espace periplasmique ME
Les G+ sont violets et les G- sont roses à la coloration de GramColoration de Gram: Perméabilité plus grande des bactéries à Gram - à l'alcool Violet de gentiane: tout est violet Lugol-iode: mordant qui renforce le violet Alcool à 90°C: chasse le violet des Gram - (décolorés), pas des Gram + (violet) Fuchsine (safranine) : colore en rose les Gram-, les Gram + restent violet
- riche en eau - 1 chromosome, des ribosomes, ARN (synthèse protéique) - glycogène (réserve énergétique) - (un ou plusieurs plasmides ou 0)
Le cytoplasme
Propriétés de la capsule
Pili (G-)
• bâtonnet creux situés dans la membrane externe • adhésion aux cellules • +++pathogènesPili sexuels
• plus longs • impliqués dans le transfert d'ADN (facteur F)Flagelles
• un ou plusieurs • mobilité spores • Bacillus et Clostridium• conditions défavorables de survie: spores • contient: génome, cytoplasme déshydraté+enveloppe
résistante• conditions favorables ; germination • caractéristique d'espèce • contamination tellurique (charbon, tétanos)
LES COCCI
Diplocoques Diplocoques encapsulés Pneumocoques Cocci en grappe de raisin Staphylococcus Diplocoques en " grain de café » Neisseria Cocci en chainettes Streptocoques Cocci en amas cubique Sarcine, Microcoque
LES BACILLES
Coccobacille Bacille de taille moyenne Ex: Escherichia coli Gros bacille Ex: Bacillus anthracis Corynebactéries Bacille fusiforme Ex: Fusobacterium Vibrions Tréponème Leptospire Campylobacter Spirille Borrelia
LES AUTRES
Atmosphère
1: aérobie strict 2: microaérophile 3: aéro-anaérobie 4: anaérobie strict Adjonction de CO2: 5%
PRINCIPALES BACTERIES »MEDICALES »
• COCCI GRAM + Streptocoques groupe A,B,C,G,F Pneumocoque ( Streptococcus pneumoniae) Staphylocoques • COCCI GRAM - MéningocoquesGonocoques • BACILLES GRAM + Corynebactéries Listeria Anaérobies ex : Clostridium
PRINCIPALES BACTERIES " MEDICALES »
• BACILLES GRAM - BrucellaBordetella Haemophilus Salmonella Shigella Yersinia E. coli Klebsiella Enterobacter Serratia Hafnia Citrobacter Proteus Pseudomonas Pasteurella Aeromonas Anaérobies ex: Bacteroïdes
ENTEROBACTERIES
PRINCIPALES BACTERIES »MEDICALES »
Tréponème syphilis
Leptospires fièvre ictéro-hémorragique Borrelia maladie de Lyme Vibrio cholera Mycoplasma infections génito urinaires ou pulmonaires Chlamydia infections génito urinaires ou pulmonaire ou trachome Rickettsia, Coxiella et bactéries apparentées (fièvres accompagnée ou non
d'exanthème ex: typhus,fièvre boutonneuse méditerranéenne)Mycobactérie et BK (Bacille de Koch) tuberculose (BK), infections à mycobactéries atypiques
Flore cutanée
• 10 2à 10
6 /cm 2 selon la topographie • Germes Gram+ potentiellement peu pathogènes (staphylocoques à coagulase négative, corynébactéries) • Flore transitoire (TD, rhinopharynx): entérobactéries, staphylocoque doré, streptocoques, et toute bactérie de l'environnementFlore digestive
La plus abondante et la plus importante Bouche: germes du rhinopharynx (streptocoques+++) et de la plaque dentaire : 10
8 par ml de salive Estomac: flore pauvre (acidité) Flore colique riche et variée: 10 11à 10
12germes par gramme (99,9% d'anaérobies dont Bacteroides et Clostridium) entérobactéries (Escherichia coli, Proteus, Klebsiella, Enterobacter,..) flore de barrage: les antibiotiques détruisent cette flore
Flore génitale
• Streptocoques (dont groupe B)• Corynébactéries • Lactobacille • Bifidobacterium • Flore cutanée dans le premier cm de l'urèthre • Colonisation par la flore digestive fréquente
Flore arbre respiratoire supérieur
• staphylocoque doré (fosses nasales+++)• streptocoques (dont pneumocoque) • Haemophilus • Neisseria (portage parfois de méningocoque) • corynébactéries • anaérobies
• bactérie commensalevit sans causer de préjudice à l'hôte Différents territoires de notre corps ont des flores particulières (ex: peau,
tube digestif,ORL, génital, ..). Ces flores sont normalement non pathogènes et utiles ( Effet " barrière ») flore saprophyte # flore commensale
• bactérie pathogène entraîne une maladie chez tout hôteSalmonella, Shigella, Brucella, gonocoque, BK,
• bactérie pathogène opportuniste habituellement inoffensive, pathogène si se retrouve dans pour le
sujet fragile ou si se trouvent dans un site normalement stérile (E. coli et urines) Bactéries dangereuses pour le patient et le personnel • Salmonella, Shigella: risque de diarrhée. Lavage mains +++ • BK: port de masque dès que suspicion médicale avant résultats de bactériologie • Méningocoque; méningite dont la prophylaxie est larifampicine et la vaccination (A et C, pas B). Personnel dans l'ambulance et qui a été en contact étroit avec le patient.
Bactéries " dangereuses » pour le patient et pas le personnel: les BMR• Bactéries multirésistantes aux antibiotiques: danger car peu de ressources thérapeutiques en cas d'infection
• Pas de risque pour la santé du personnel (femmes enceintes) ni deson entourage (mucoviscidose, cancéreux) à condition de respecter les règles élémentaires d'hygiène
• Responsabilité du personnel : mettre tout en oeuvre pour éviter la propagation de ces bactéries résistantesLes virus
- de très petite taille de l'ordre du nanomètre, observables au microscope électronique. - parasites intracellulaires obligatoires. - son principe est de détourner à son profit le fonctionnement d'une cellule après l'avoir parasitée1. structure générale
Génome : 1 seul acide nucléique :
ARN : Grippe, HIV... ADN : Herpès, V hépatite B...Capside : " boîte » protéique,
cubique ou hélicoïdaleEnveloppe ou non
1. structure générale
2. parasitisme intra-cellulaire
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