Virus de lhépatite B (VHB)
Le gène P qui représente plus de 80% du génome code l'enzyme clé responsable de la réplication du génome viral l'ADN polymérase
HEPATITE B
Le VHB est un petit virus enveloppé dont le génome est fortement compacté et organisé sous la forme d'un ADN viral partiellement bicaténaire et circulaire.
La culture du virus de lhépatite
carcinoma in hepatitis B virus transgcnic micc. mes de réplication du VHB. ... La flèche indique cinq virions dans une structure cellulaire compati.
Analyse du mécanisme dentrée du virus de lhépatite B
6 juil. 2010 Traitement de l'infection chronique par le VHB . ... structure du virus et particulièrement de celle de ses protéines de surface
Variabilité génétique du virus de lhépatite B et implication sur le
24 sept. 2013 La capside virale formée des protéines de capside (HBc) protège le génome viral qui est sous forme d'ADN double brin relâché-circulaire de 3
Prise en charge des personnes infectées par les virus de lhépatite B
Dans cette logique le rapport s'est structuré autour de trois grands axes : prévention
Variabilité du virus de lhépatite B
14 avr. 2015 Virus de l'Hépatite B. Structure de la particule virale. Le VHB est un virus à ADN de la famille des Hepadnaviridae dont la particule.
Influence des protéines denveloppe du virus de lhépatite B sur la
30 mars 2018 L'infection par le virus de l'hépatite B .. ... l'identification de la structure du génome viral (Robinson et al. 1974 ; Summers et al.
·VIRUS DE LHÉPATITE ET HÉPATOCA -RCINOME
les structures et les modes de réplication de ces virus sont entièrement différents. L'hépatite A est due à un picornavirus l'hépatite B à un virus.
VIRUS DE LHEPATITE B (VHB)
o Ag HBs = infection en cours ou portage chronique. o Ag HBe = infection en cours multiplication virale importante. o Ac anti-HBe = absence de réplication
Images
The hepatitis B infection occurs in adolescents and adults and can lead to acute hepatitis subclinical infection or the development of chronic infection The incubation period ranges from 45–160 days with an average of 75 days followed by an insidious onset of acute disease (Figure 2) Figure 2 Morphology of hepatitis B virus M L S
Hepatitis B - Basic Information - Centers for Disease Control
the Hepatitis B virus again Chronic Hepatitis B refers to a lifelong infection with the Hepatitis B virus The likelihood that a person develops a chronic infection depends on the age at which someone becomes infected Up to 90 of infants infected with the Hepatitis B virus will develop a chronic infection
Hepatitis B Virus (HBV) Hepatitis B Virus
Hepatitis B Virus (HBV) HBV is a small double-stranded DNA virus in the family Hepadnaviridae Serologic markers for HBV infection include HBsAg antibody to HBsAg (anti-HBs) immunoglobulin class M (IgM) antibodies to hepatitis B core antigen (IgM anti-HBc) and immunoglobulin class G (IgG) anti-HBc (IgG anti-HBc) At least
Skip to
The hepatitis B virus
The Hepatitis B Virus
Hepatitis B virus (HBV) is a pararetrovirus that infects hepatocytes. HBV has an easily available vaccine but no cure. Approximately 257 million individuals are infected with HBV globally, and nearly 900,000 die each year related to disease complications, including liver failure or hepatic cancer.
Initiation of A Hepatitis B Viral Infection
The HBV surface is composed of HBV surface antigen (HBsAg) particles. The HBV virions (also referred to as Dane particles) are comprised of HBsAg particles. To initiate an infection, the Dane particle bind to sodium-taurocholate co-transporter polypeptides (NCTPs) on the surface of hepatocytes, which allows the virion to be transported into the cyt...
The Structure of The Hepatitis B Virus
The hepatitis B virus is interesting in its ability to use relatively few virus proteins to carry out a wide range of actions. HBcAg exists as a soluble dimer with an RNA binding domain. The structure of HBcAg dimers can vary with dimers in capsids being more compact than free dimers in solution. Regulation of HBcAg can change the conformational st...
The Effect of HAP1 on Hepatitis B Capsids
A heteroarylidihydropyrimidine (HAP1) is an HBV capsid assembly activator and misdirector. Knowledge of this activity would be extremely beneficial to the development of antiviral strategies against HBV infections. The capsid structure has been analyzed with and without the influence of HAP1. This analysis discovered that HAP1 causes structural cha...
Capsid-Directed Antiviral Strategies
HBcAg can potentially be used as an antiviral target due to its role in the formation of capsids and the life cycle of HBV. Also, as capsids have no human homolog, they make great targets for therapeutic intervention. Research has shown that altering temperature and ionic strength of the HBcAg monomers can lead to the formation of aberrant non-caps...
DOCTEUR DE
ÉCOLE DOCTORALE DES SCIENCES DE LA VIE ET DE LA SANTÉSPÉCIALITÉ
: MicrobiologieSomar Kassab
Variabilité du virus de l'Hépatite B
Sous la direction de
Michael Kann
Mr le Docteur Jean ROSENBAUM (directeur de recherche, INSERM 1053)Président
Mr le Docteur David DURANTEL (chargé de recherche, INSERM 1052)Rapporteur
Mr le Docteur Patrick SOUSSAN (MCU-PH, INSERM 1135) Rapporteur Mr le Professeur Michael KANN (directeur de l'UMR-CNRS 5234) Directeur de thèse Titre : Variabilité du Virus de l'Hépatite BLe polymorphisme génétique du virus de l'hépatite B (VHB) a déjà été étudié pour
tenter de comprendre les facteurs viraux influençant l'évolution de la maladie, mais les études
sont discordantes. Ceci peut être lié au fait que les précédents travaux n'ont été menés que
dans des populations avec une faible variété de génotype s et présentant des charges virales plasmatiques (CVP) élevées. Nous avons donc étudié la variabilité du génome complet du VHB chez 422 individus infectés chroniquement, naïfs de traitements anti-viraux et dont 38% présentaient une CVP inférieure à 10 3 UI/mL. L'optimisation de l'amplification par PCR du génome complet du VHB nous a permis de séquencer en technique Sanger plus de 90% du génome pour 320échantillons. Le séquençage direct a mis en évidence des co-infections. Ceci a été confirmé en
séquençage clonal par pyroséquençage de 27 échantillons qui a montré des proportions de
particules défective s variables mais toujours en co-infections avec des sous-populations sauvages. Le génotypage des séquences obtenues par technique Sanger a montré une grandereprésentativité des génotypes les plus fréquents (A à E) ainsi que 60 potentiels recombinants
inter-génotypiques. Cependant le séquençage clonal par pyroséquençage et clonage vectoriel
classique de ces dernie rs montre la présence de co-infections de plusieurs génotypes ou la présence de génotypes intermédiaires entre génotypes proches. Ceci est en défaveur derecombinaison par échange de matériel génétique comme ce qui a été suggéré dans la
littérature. Cette étude sera complétée par l'analyse de corrélation entre les polymorphismes et les marqueurs de mauvaise évolution de la pathologie.Mots clés
Virus de l'Hépatite B, variabilité interindividuelle, variabilité intraindividuelle, virus défectif, recombinant inter-génotypique.Title : Hepatitis B Virus variability
The genetic polymorphism of hepatitis B virus (HBV) has been investigated to understand its impact on disease evolution, with discordant results. This could be due to the narrow range of genotype and plasmatic viral load in these studies. We analysed complete genome variability of circulating HBV, in 422 chronically infected patients. All were naive of anti-viral treatement and 38% had a plasmatic viral load below 10 3 UI/mL. After optimisation of full length genome PCR amplification, we obtainedSanger sequences
for more than 90% of HBV genome in 320 samples. We detected by direct sequencing multiples co-infections that were confirmed by clonal pyrosequencing in 27 samples. Defective viruses were always observed in co-infection with wild type virus. Direct sequences showed a large representation of the most frequent genotypes (A to E), but also 60 potential inter-genotypic recombinants. Clonal pyrosequencing and vectorial sequencing showed that these potential recombinants were co-infections with different genotypes or intermediate genotypes located between close genotypes. These observations are in contradiction with the hypothesis described in the literature on recombination by genetic material exchange. This study will be completed by a correlation analysis between the polymorphisms and markers of bad prognosis during HBV-induced disease.Keywords :
Hepatitis B virus, inter-individual variability, intra-individual variability, defective virus, inter-genotypic recombinant.Unité de recherche
Laboratoire de Microbiologie Fondamentale et PathogénicitéRemerciements
difficiles. de moi acceptée e. mener - te Vir perfectionnisme. Aurélia, je te souhaite tout le meilleur et te remercie du fond du coeur.CHU de Bordeaux
avoir partagé son savoir sur le VHB et son intérêt pour ce travail.Plateau
Sommaire
Sommaire
Liste des abréviations
Introduction
Généralités
Structure de la particule virale
Organisation du génome
Cycle viral
Réponse immunitaire
Pathologies
Infection aiguë
Infection chronique
Fibrose et carcinome hépato
Prévention et traitement
Variabilité du VHB
Hepadnaviridae
Génotypes
adieMatériels et méthodes
Prélève
Extraction des acides nucléiques
Amplification du génome complet par PCR
PCR pour les charges virales supérieures à 103 3 PCR nichées sur produit de PCR génome completSéquençage direct par méthode Sanger
Réactions d
Analyse des séquences
Conception des amorces de réactions de séquencePyroséquençage avec la technique 454
Principe
Conception des amorces
Purification des amplicons avec le protocole Agencourt® Ampure® XP de BeckmanDosage des amplicons avec le kit Quant
sion (emulsionAnalyse des séquences
Séquençage clonal
Clonage vectoriel plasmidique, technique In
Clonage vectoriel plasmidique, pGEM®
Séquençage des plasmides
Entropie de Shannon
Résult
3UI/ml
Séquençage direct du génome vi
Amplification du génome complet du VHB
Taux de couverture par séquençage du génome viralPopulations multiples
Vérification des c
Génotypes
Séquençage clonal par pyroséquençage
Choix des échantillons
Le contrôle plasmidique
Pyroséquençage des patients
Co CoDélétions
Codons STOP
Séquençage clonal classique
Recombinaisons
Délétions
Discussion
Polymorphisme du génome du VHB
Codons stop
CoGénotypes indéterminés
Perspectives
Conclusion
Annexes
Annexe
Annexe
Références
Liste des abréviations
épatite B de la marmotte
Introduction
(VHB) C, ils sont les principaux agents infectieux responsables de cancer e organisentFiguremodéré à fort
zones correspondentGénéralités
VStructure de la particule virale
42enveloppe entourant DN, une polymérase
Figure
bourgeonnement de la HB .VDXIOH4ème er nd
nd èmeérieur de la par
(5) pour les génotypes B, E et partiellement C et D surFigure Į
transmembranaires. ème ème Į e, , asparagine 146 (losange, est Nphosphorylé sur la sérine 118 bien que cette dernière ne soit pas indispensable à infectivité
Figure
la particule virale, LHBs expose le site de domaine matrice (DM) interagit avec la capside.Des trimères de cnt
Figure
aĮ es pics des
poly core une u brinOrganisation du génome
Les 4 cadres de lecture
ène HBe (
Ilțrs hépatiques tel
HBe préSFigure
chapitre 2, edited by C.L. Lai and S. Locarnini, second edCycle viral
médiaire du domaine N irculaire covalemment clos (ADNccc) via les étapesFigure
(ADNccc) qui est capside immature dans laquelle soit redirigée vers le noyau pour augment- tre libérées dans le milieu extracellulaire. A partir du RE pseudoolgi pour ê cellulaire pour deux extrémités sont chevauchantes et dont les deux extrémités sont chevauchantesFigure
e cha produisant une protéine de 15 indispensable à cette dernière. En effet, des patients sontHBx est
atocytes humain e activant les protéines des voies de transduction telles que Src kinase iİde
9La ne . Ces
Figurİdans le domaine précore.
de la Polymérase dég - 10 - r . Lx le saut de brin de DR1 vers DR2ADN double linéaire (ADNdl) (figure
Figure
la polymérase dégradé- pas lieu dans toutes les cellules infectées (0.2% des hépatocytes pour WHV ans il a été décrit une peut être perturbée. (71) (73) ligasesȖ(74)
4 R cytokines sécrétées non seulement par les , les lipopolysaccharides de gènes codant pour des cytokines (Interleukines, InterféroFigure
des activation iTableauISG
ISG Mécanismes anti-VHB
MyD88 (83) Dégradation des ARNm dans le cytoplasmeMxA (84) (85) Inhibition de
coreCNP (86) Inhibition de la traduction des ARNm
Indoleamine 2,3-deoxygenase (87) Inhibition de la traduction des ARNm Zinc Antiviral Protein (88) Dégradation des ARNm dans le cytoplasme APOBEC3 A et B(figure 12) (89) Désamination des ADNccc induisant leur dégradation Inhibition de la transcription des gènes viraux Figure les désaminases de la famille p-Į empêchant la translİprotéines adaptatri
e ité adaptative immunologique. t la réponse immunitaire contreles hépatocytes infectés sécrètent une protéine chaperone sHSP60 qui activerait les LTreg par
le VHB,infection é Pprincipalement liée à la réponse immunitaire contre les hépatocytes infectés et à son pouvoir
infectionInfection aiguë
sexuelle et par un istent 6 , débute la cytolyse hépatique aiguë se traduisant hépatocellulaire traitement est la greffe de hépatique en niParallèlement, on observe une séroco
les AcHBs. persiste de façon latente dans le no acquise ouInfection chronique
HBs alors devenue persistante chronicisation de- envers les épitopes viraux les hépatocytes infectés (ASAT/ALAT normales) malgré une réplication virale intense av 6 , il existe un équilibre permanent et dynamique , peut survenir une phase c une réaction lymphocytaire cytolytique faisant augmenter les séroconversion une immunotolérance.incidence annuelle cellulaireTableau
Immunotolérance Séroconversion HBe Inactive Réactivation Mutant préCAgHBs + + + + +
AcHBs - - - - -
AcHBc + + + + +
ADN +++ Ļ - Ĺ ++
AgHBe ++ Ļ - Ĺ -
AcHBe - Ĺ ++ Ļ +
ASAT/ ALATème
ar les L n viraleFibrose et c
quotesdbs_dbs44.pdfusesText_44[PDF] mise en scène mariage de figaro
[PDF] elles réunissent une proposition principale avec une proposition subordonnée
[PDF] noms composés exercices pdf
[PDF] le pluriel des noms composés exercices
[PDF] le pluriel des noms pdf
[PDF] nom composé exemple
[PDF] maths facile
[PDF] répond moi ou réponds moi
[PDF] reponds moi
[PDF] calculer vergence oeil
[PDF] je répond
[PDF] je vous répond
[PDF] répondre définition
[PDF] je te réponds