[PDF] [PDF] Notes de Cours sur le logiciel R





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  • Comment faire une courbe sur R ?

    La fonction la plus couramment utilisée pour produire des graphiques dans R est la fonction plot() . plot() est une fonction générique dont le comportement s'adapte automatiquement à la nature de ses arguments. Il y a deux syntaxes possibles pour cette fonction : syntaxe classique: plot(x = varX, y = varY)

  • Comment commencer R ?

    Créer son premier script R
    Pour cela, cliquez sur File > New File > R Script ou vous pouvez utiliser le raccourci clavier CTRL + MAJ + N. Votre nouveau script s'ouvre dans la partie éditeur, vous pouvez commencer votre code.

  • Comment utiliser R ?

    Pour utiliser le logiciel R sous Windows, il faut ouvrir une session de travail. Pour ouvrir une session sous Windows, il faut cliquer sur l'icône R du bureau de façon à ouvrir une fenêtre. Les données de travail et les commandes utilisées seront alors enregistrées à l'endroit où R a été installé.
  • Cliquez sur Rectangles et Barres (à gauche de l'histogramme), puis sur Intervalles et Etiquettes. En somme dans R++, modifier un histogramme se fait sans code, comme dans MS Excel. Mais en un clic, vous pouvez visualiser tous les histogrammes de toutes les variables numériques.

NotesdeCours surle logi cie lR

AnnePHILIPPE

22janvi er2018

UniversitédeNantes,

LaboratoiredeMathématiquesJeanLe ray

email:Anne.phi lip pe@math.univ-nantes.fr 1 Plan

1.Obje tsetOpérations

2.Lesf onctions

3.Lesgra phiques

4.Grap hiquesavecggplot2

5.Struc turesdecontrôleetItérations

6.Autou rdesloisdeproba bilités

7.Outil sgraphiquesens tatistique

8.Infé rencestatistique

9.Séries Chronologiques

2

Installation

Lelogicie lRestunfreewaredisponiblesurlesite

http://cran.r-project.org/

Ilexiste desversions

•Windows •MacOSX •Linux...

Outilsdisponible s:

•unlang agedeprogrammationori entéobj et •desfonctio nsde"base" •deslibrai ries/packagescomplémentaires(1800surlesiteCRAN) 3

Documentations

•Documentssurlelogiciel R: •Siteconsa créauxgraphiques addictedtor.free.fr/graphiques/ •CollectionspécifiqueUseRchezS pringer •Plusde80livr es, parexempl e •IntroductoryStatisticsWithR •BayesianComputationWithR •AppliedStatisticalGen eticsWithR: •GeneralizedAdditiveModels:An IntroductionwithR •ExtendingtheLinearModelWithR •TimeSeries AnalysisAndItsAp plications:WithRExamples 4

Audémarra ge

>apparaît automatiquementen débutdecha queligne decom mandes +apparaîtendébutde lignesila ligne précédenteest incomplète 5

Souslinux

6

Utiliserl' aide

>help("plot") >?plot >help.search("plot") >??plot

Lesdémos:

#pourobtenirlalistedesdemos >demo() >demo(graphics)

Lesexemple s:

Lafonc tionexampleexécutelesexemple s

d'aide. >example(FUN) 7

Éditeur

SousMacOSet Windows,unéditeu rdetextei ntégréaulogicielR •CtrlRexécutelalignesu rlaque llesetrouvelecur seuroules lignes d'unblocsél ectionné. •source("nom-du-fichier.R")po urexécuterlec odecontenudans lefichie rnom-du-fichier.R 8

Librairies

•Toutesleslibrai riesneson tpaschargéesaulancementdulogi ciel •library()retournelalistedeslibr airies installées. •library(LIB)chargelalibrai rieLIB •library(help=LIB) retournelalistedesfoncti onsde lalibrairie LIB •search(),searchpaths() retournelalistedeslibra iries chargées. 9

ObjetsetOpérations

Opérationsélémentaires

1.Opérationsélémentairessurles scalaires:!,",+,/,ˆ

>2+4 6

2.Opérationsaveca!ectation(avecousansa "chage)

x=2+4 x 6 (x=2+4)#avecaffichagedurésultat 6

3.Lesprinc ipauxtypessont

•entier,réel,comple xe •caractère •logique:TRUE,FALSE,NA( not available) 10

Objets

Lesobjets debasesont

•vecteurs,matrices •data.frames,listes

Quelquesfonctionsgénériq ues:

•ls()retournelalistedesobje tsdelas ession. •rm(a)supprimel'objeta 11

Fonctionsis/as

•is.xxx(obj)testesiobjestunobj etdetyp exxx •as.xxx(obj)contraintsipossibleobjautyped 'objetxxxoùxxx représenteuntyped'objet(comp lex,rea l,vectormatr ixetc...) >x=3 >is.real(x) [1]TRUE >is.complex(x) [1]FALS E >as.complex(x) [1]3+0i >as.character(x) [1]"3"

Remarque:

ConversiondeTRUE/FALSEenvale urnumé rique:

>as.integer(T) [1]1 >as.integer(F) [1]0 12

Créerdesvect eurs

•lafonc tionc()concatènedesscalairesoud esvecteurs: >x=c(1,4,9) >y=c(x,2,3) >y [1]1492 3 •Suitesarithmétiqu esderaison1ou-1:c(a:b). >c(1:4)>c(4:1) #abraison!1 [1]1234 [1]4 321 #a!bn'estpasunentier >c(1.4:7) [1]1.42 .43.44.4 5.46.4 13 •Généralisation:seq(a,b,t)oùaestpremi erterme,ledernier#b etla raisont seq(from,to)larais onest1 seq(from,to,by=)onfixelarais on parexempl e >seq(1,4,by=0.1) [1]1.01 .11.21.31 .41.51.61 .7.... [26]3. 53.63.73 .83.94.0 •x=rep(y,n) pourcréerun vecteurconstituédel 'éléme ntyrépété nfois.(ypeutêtreunsc alaireouu nvecteur )parexemple >rep(1,4) [1]1111 14

Créerdesmatrice s

Lesmatrice ssontcrééesaveclafonc tionmatrix()àpar tir d'unvecteur. Ondoit fixerlenombred ecolon nesncolet/oulenombr edelig nesnrow. >x=matrix(c(2,3,5,7,11,13),ncol=2) Pardéfau tlamatriceestrempli ecolon neparcolonne.Pour remplirl igne parligne ,onajoutel'argument byrow=T >y=matrix(c(2,3,5,7,11,13),ncol=2,byro w=T) >x>y [,1][,2][,1 ][,2] [1,]27[1,] 23 [2,]311 [2,] 57 [3,]513[3 ,]1 113 15 Attention:si ladim ension duvecteurn'estpaségaleauprod uit(ncol $nrow)al orsl'opératione !ectuéeestlasuiva nte: >matrix(c(1:3),ncol=2,nrow=3) [,1][,2] [1,]11 [2,]22 [3,]33 >matrix(c(1:3),ncol=2) [,1][,2] [1,]13 [2,]21 16 Quelquesmatricesparticuliè res:diagonale,Toepl itz >diag(1:4) [,1][,2][,3 ][,4] [1,]1000 [2,]0200 [3,]0030 [4,]0004 >toeplitz(1:4) [,1][,2][, 3][,4] [1,]123 4 [2,]212 3 [3,]3212 [4,]432 1 diag Lafonc tiondiagretourneunematricediag onalelors queleparamètre d'entréeestunvecteur. Silepa ramètr ed'entréeestunematrice,al orselleretourneunvecteur constituédeladiagonaled elama trice 17

Concaténerdesvecteurs/matrices

•rbind •cbind >x=1:10 >y=x^2 >rbind(x,y) [,1][,2][, 3][,4][,5] [,6][,7][,8][, 9][,10] x12345678910 y149162536496481100 >cbind(x,y) xy [1,]11 [2,]24 [3,]39 [4,]416 [5,]525 [6,]636 etc 18 Extrairedesélémentsd' unvecteu roud'unematrice >vect=c(1.5:9.5) >vect [1]1.52 .53.54.5 5.5

6.57.58.59.5

>mat=matrix(vect,ncol=3,nrow=3) [,1][,2][,3 ] [1,]1.5 4.57.5 [2,]2.55 .58.5 [3,]3.5 6.59.5

Extraireunélément

>vect[1]>mat[2,1] [1]1.5[1] 2.5

Colonne/ligned'unematrice

>mat[,1]>mat[3,] [1]1. 52.53.5 [1]3. 56.59.5

Extraireunblocouplu sieurs coordonnées

>mat[2:3,1:2]>vect[c(1,3,7)] [,1][,2][1 ]1.53.57. 5 [1,]2.55 .5 [2,]3.56 .5 Attention:vect[-j]retournelevecteurvectsanslajèmeco or donn ée >vect[!c(1,3,7)]retourne2. 54.55.56.58.59.5 19

OpérationssurlesMatrices/Vec teurs

•Lesopérati ons+*-/entre2vecteursoumatrice sd emê me >x [1]1234 5 >y [1]000 11 >x"y [1]000 45 >A [,1][,2] [1,]21 [2,]49 >B [,1][,2] [1,]02 [2,]11 >A"B [,1][,2] [1,]02 [2,]49 20

Attention

Silesve cteursnes ontpasdemêmelongu eur,

leplus courtestcom plétéautomatiqueme nt. >x=c(1:5) >xx: 12 345 [1]123 45y :12 121 >y=c(1,2)!!!!!!!!!!!!!!!!! >yx+ y:24466 [1]12 >x+y [1]2446 6 21
Quelquesopérationsparticu lièressurlesmatrices >a=matrix(1,ncol=2,nrow=2) >a [,1][,2] [1,]11 [2,]11 >a+3#matrice+scalaire [,1][,2] [1,]44 [2,]44 >a+c(1:2)#matrice+vecteur [,1][,2] [1,]22 [2,]33 22

Actiond'unefonctio nsurunvecteuro uunematrice

SoitFUNunef onctiondéfin iesurless calairesquiretourneun scalaire.

Parexempl e

sqrtsquareroo t absabsolutevalue sincostantrigonometricfunctions(radians) explogexponentialandnatu rallogari thm log10commonlogarit hm gammalgammagammafunctionandit snatural log Lorsqueleparamètred'e ntréees tunvecteur(respectivementun e matrice),lafonctionFUNest appliq uéesurchacunedescomp osantes. L'objetretournéestunve cteur(respectivementune matrice). s

Exemple

SiA=(a

i,j )estunema trice,alor sexp(A)retourneunematrice constituéedesélémentse a i,j 23

Quelquesfonctionssurles matrices

•Leprod uitmatricielestobtenu avec%!% •Calculdesvaleurs/ve cteursprop res:eigen •Calculdudéterminan t:det •t(A)retournelatransposéede lamatri ceA X=R RoùRestunematr icetriang ulairesupérieuree tR estla transposéedeR. •décompositionsvd:svd(X)retourne(U,D,V)tellesqu eX=UDV oùUetV son tortho gon alesetDestdi agonale. solve •solve(A)retournel'inversedelam atriceAquotesdbs_dbs44.pdfusesText_44
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