[PDF] Identification des bactéries cultivables (nouvelle version)





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Identification des bactéries cultivables (nouvelle version) Identification des bactéries cultivables (nouvelle version)

Responsable technique de la méthode. Geneviève Marchand Ph.D d'identification pour vérifier les caractéristiques biochimiques de la souche à identifier.



aide-memoire-microbiologie-identification-des-bacteries.pdf

Tests pour identifier les bactéries. Toujours utiliser une technique stérile pour manipuler les bactéries. De plus pour chacun des tests



Méthode déchantillonnage et didentification de bactéries et de

Ce document technique a été financé par l'IRSST. Les conclusions et recommandations sont celles des auteurs. Méthodes de laboratoire. MÉTHODE ANALYTIQUE 343.



Identification des champignons dimportance médicale

• Purification d'une souche contaminée par des bactéries Note: cette méthode est de plus en plus délaissée et remplacée par des techniques d'identification.



Méthode 341 - Identification des bactéries cultivables

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Fiche technique pour la gestion des cas et des contacts - Infections

6 déc. 2016 - La mise en culture du spécimen et la détection des acides nucléiques des bactéries Haemophilus influenzae (Hi) sont des tests qui sont ...



Méthode 370 - Détection et identification des bactéries du genre

7 juill. 2015 La capacité d'obtenir une culture pure de chaque type de colonie caractéristique de la Legionella ... technique de prélèvement pour la recherche ...



Fiche technique sur la maladie de Lyme - Mai 2022

L'identification précise du lieu d'acquisition de la ML repose sur une analyse scapularis peut être vectrice d'autres bactéries dont Anaplasma.



MA. 700 – Col 1.0 Recherche et dénombrement des coliformes

La technique décrite précédemment est une méthode de dénombrement et d'identification identification de la bactérie isolée détermine l'ampleur que prendra la ...



STA 1.0 Recherche et dénombrement de Staphylococcus aureus

la bactérie recherchée à l'aide d'une seule réaction biochimique caractéristique. D'autres marques de galeries biochimiques d'identification ou d'autres.



Identification des bactéries cultivables (nouvelle version)

Ce document technique a été financé par l'IRSST. Les conclusions et recommandations sont celles des auteurs. Méthodes de laboratoire. MÉTHODE ANALYTIQUE 341.



Guide pratique des bactéries pathogènes

Fiches pratiques des principales bactéries pathogènes. IV. Règles d'or de la lecture Diagnostic direct : isolement et identification de la bactérie.



aide-memoire-microbiologie-identification-des-bacteries.pdf

obtenus et les techniques de manipulation. Morphologie. Étapes pour réaliser le test. - Réaliser un frottis des bactéries à l'aide d'un incinérateur.



Manuel des Travaux Pratiques de Bactériologie

Quelques milieux d'identification de galerie classique.………………… 28 la reconnaissance des caractéristiques d'une culture bactérienne (caractères.



Outils moléculaires didentification en bactériologie*

Les techniques de biologie moléculaire ont été appliquées à l'étude d'outils d'identification des bactéries. En particulier le séquençage de produits 



Outils moléculaires didentification en bactériologie*

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PCR et séquençage du gène ARN 16S

Enfin la technique est utile pour l'identification de bactéries non cultivables ou difficiles à cultiver



Staphylococcus epidermidis FICHE TECHNIQUE BACTERIOLOGIE

Bactérie ubiquitaire. L'amélioration des techniques d'identification des Staphylocoques a permis de mieux différencier les espèces de Staphylocoques à " 



GALERIE DIDENTIFICATION MINIATURISEE LE SYSTEME API

FICHE TECHNIQUE. GALERIE API 20E ®. MICRO-GALERIE. PRINCIPE : Le système API® BioMérieux (Appareillage et Procédé d'Identification) est une version 

Comment identifier une bactérie ?

Dans la plupart des cas, l'identification est faite sur la base de l'élimination. Pour identifier une bactérie, vous devez effectuer des tests de coloration, analyser son apparition et observer comment elle réagit bien à des conditions différentes. Si vous avez besoin d'un résultat rapide, prélevez un échantillon d'ADN à envoyer à un laboratoire.

Qu'est-ce que les bactéries ?

Les bactéries sont des organismes unicellulaires microscopiques. Elles font partie des premières formes de vie connues sur Terre. Il en existe des milliers de types différents, et elles vivent dans tous les environnements possibles, partout dans le monde. Elles vivent dans la terre, dans la mer et dans les profondeurs de la croûte terrestre.

Comment les médecins classent les infections bactériennes ?

Les médecins classent les infections bactériennes selon les façons dont ils classent les bactéries. Par exemple, les infections peuvent être classées comme étant provoquées par des bactéries Gram négatives ou Gram positives. Cette distinction est importante car le traitement des deux types peut nécessiter différents types d’antibiotiques.

Méthodes

de laboratoire

MÉTHODE ANALYTIQUE 341

Applicabilité

Cette méthode est utilisée pour identifier des bactéries cultivables.

Norme(s)

1

Aucune norme.

Système d'échantillonnage

Matrices multiples.

Volume et débit d'échantillonnage recommandés N.A.

Analyse

Stéréomicroscopie à fibre optique, microscopie à la lumière transmise, chromatographie en phase gazeuse.

Valeur minimale rapportée (VMR)

N.A.

Domaine d'application

N.A.

Fidélité

N.A.

Incertitude analytique (CV

A N.A.

Identification des bactéries cultivables

Solidement implanté au Québec depuis l980,

l'Institut de recherche Robert-Sauvé en santé et en sécurité du travail (IRSST) est un organisme de recherche scientifique reconnu internationalement pour la qualité de ses travaux.

Mission

Contribuer, par la recherche, à la prévention des accidents du travail et des maladies professionnelles ainsi qu'à la réadaptation des travailleurs qui en sont victimes. Offrir les services de laboratoires et l'expertise nécessaires à l'action du réseau public de prévention en santé et en sécurité du travail. Assurer la diffusion des connaissances, jouer un rôle de référence scientifique et d'expert. Doté d'un conseil d'administration paritaire où siègent en nombre égal des représentants des employeurs et des travailleurs, l'IRSST est financé par la Commission de la santé et de la sécurité du travail.

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Dépôt légal

Bibliothèque et Archives nationales

2009

ISBN : 978-2-89631-346-4 (PDF)

ISBN : 978-2-89631-255-9 (1

re

édition, 2008)

ISSN : 0820-8395

IRSST - Direction des communications

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en santé et en sécurité du travail, 2009
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Ce document technique a été financé par l'IRSST. Les conclusions et recommandations sont celles des auteurs.

Méthodes

de laboratoire

MÉTHODE ANALYTIQUE 341

Avis de non-responsabilité

L'IRSST ne donne aucune garantie relative à

l'exactitude, la fiabilité ou le caractère exhaustif de l'information contenue dans ce document.

En aucun cas l'IRSST ne saurait être tenu

responsable pour tout dommage corporel, moral ou matériel résultant de l'utilisation de cette information.

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protégés par les législations canadiennes applicables en matière de propriété intellectuelle. Les méthodes d'analyses ou d'étalonnage sont celles mises au point ou retenues par l'IRSST pour l'exécution de ses différents mandats. Elles peuvent requérir l'utilisation de matériels, d'opérations ou d'équipements dangereux. Ces méthodes n'ont pas pour but de mentionner tous les problèmes de sécurité associés avec leur utilisation. C'est la responsabilité de l'utilisateur d'établir les pratiques de santé et de sécurité appropriées. L'utilisation des données incluses dans ces méthodes se fera aux seuls risques de l'utilisateur : l'IRSST se dégage de toute responsabilité.relative aux erreurs ou aux dommages qui découleraient de telle utilisation et de telle application. Les hyperliens qui apparaissent dans ce document ont été validés au moment de la publicationResponsable technique de la méthode

Geneviève Marchand, Ph.D., microbiologiste,

Services et expertises de laboratoire, IRSST

Approbation

Geneviève Marchand, Ph.D., microbiologiste,

Marie-Claude Barrette, M.Sc., chimiste,

responsable du programme d'assurance qualité et Jacques Lesage, M.Sc., chimiste, directeur,

Services et expertises de laboratoire, IRSST

Autorisation pour publication

Marie Larue, M.Sc., présidente-directrice générale

Préside

nce-direction générale, IRSST

Identification des bactéries cultivables

Les résultats des travaux de recherche publiés dans ce document ont fait l'objet d'une évaluation par des pairs.

CONFORMÉMENT AUX POLITIQUES DE L'IRSST

TABLE DES MATIÈRES

1. Principe de la méthode........................................................................

2. Interférences........................................................................

3. Matériel........................................................................

4. Réactifs........................................................................

5. Échantillonnage........................................................................

6. Protocole analytique........................................................................

7. Paramètres d'application........................................................................

7.1 Limite de détection et limite de quantification 7

7.2 Fidélité 7

7.3 Exactitude 7

7.4 Incertitude de mesure 7

8. Contrôle de qualité........................................................................

8.1 Contrôle inter laboratoire 7

8.2 Contrôle des produits utilisés 7

9. Santé et sécurité........................................................................

10. Références........................................................................

11. Bibliographie........................................................................

Méthode analytique 341- Identification des bactéries cultivables

Page 4

Préambule

La Loi sur la santé et la sécurité du travail au Québec a comme objet l'élimination à la source des dangers

pour la santé, la sécurité et l'intégrité physique des travailleurs. Des valeurs d'exposition admissibles (VEA)

aux substances chimiques ont été fixées à l'annexe 1 du Règlement sur la santé et la sécurité de travail

(RSST). L'article 44 de ce règlement intitulé " Méthodes » spécifie que :

" ... Ces gaz, ces fumées, ces vapeurs, ces poussières et ces brouillards présents dans le milieu de

travail doivent être prélevés et analysés de manière à obtenir une précision équivalente à celle

obtenue en appliquant les méthodes décrites dans le Guide d'échantillonnage des contaminants de

l'air en milieu de travail publié par l'Institut de recherche Robert-Sauvé en santé et en sécurité

du travail ... »

Pour atteindre ces objectifs, des méthodes d'analyse visant à quantifier le degré d'exposition des

travailleurs sont développées et rédigées pour implanter les moyens de contrôle adéquats. Afin d'assister

les intervenants en milieu de travail, l'IRSST publie, révise périodiquement et diffuse le Guide

d'échantillonnage des contaminants de l'air en milieu de travail et la direction Services et expertises de

laboratoire publie des méthodes d'analyses des contaminants.

Ces méthodes doivent être utilisées de concert avec les références réglementaires et normatives

suivantes :

Loi sur la santé et la sécurité du travail. L.R.Q., chapitre S-2.1. Éditeur officiel du Québec, (1

er août 2007).

Règlement sur la santé et la sécurité du travail. S-2.1, r.19.01, Décret 885-2001. Éditeur officiel du Québec (25

juillet 2007).

S2_1R19_01.htm

Guide d'échantillonnage des contaminants de l'air en milieu de travail. Direction des opérations, IRSST, T-06

Guide technique, Montréal, Québec, (mars 2005). NIOSH, National Institute for Occupational Safety and Health .

ISO Guide 30, Termes et définitions utilisés en rapport avec les matériaux de référence, 2

e

édition, 1992.

ISO, Vocabulaire international des termes fondamentaux et généraux de métrologie, 2 e

édition, 1993.

American Industrial Hygiene Association (AIHA), organisme qui accrédite le laboratoire de l'IRSST dans le

domaine de l'analyse des contaminants chimiques en milieu de travail et pour l'analyse environnementale

microbiologique. Par ailleurs, toute la terminologie utilisée dans cette méthode est décrite dans l'instruct ion de travail

" I-G-014 » du système de gestion documentaire associée au système qualité de l'IRSST.

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Méthode analytique 341- Identification des bactéries cultivables

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1. PRINCIPE DE LA MÉTHODE

Isoler en culture pure des colonies de bactéries. Procéder à leur identification à partir de

caractérisations macro et microscopiques, du profil en acide gras (méthode IRSST-344) ainsi que de

tests biochimiques.

2. INTERFÉRENCES

La sensibilité de cette méthode varie selon : La rencontre des conditions de croissance des microorganismes à leur développement ;

Une surpopulation ;

L'envahissement de microorganismes sur un pétri qui rend l'isolement difficile ; L'obtention d'une culture pure de chaque colonie.¹

3. MATÉRIEL

Géloses :

- Trypticase de soya - Autres selon les besoins

Tige bouclée

Microscope à lumière transmise muni d'un contraste de phase

Oculaire 10X ou 12,5X

Objectifs (ex :10X, 40X, 60X et 100X)

Lame et lamelle

Stéréomicroscope 20X-120X

Source lumineuse à fibre optique

Chromatographe en phase gazeuse avec colonne de silice fondue

Base de données informatique " Sherlock »

Base de données informatique " Biolog »

Réfrigérateur à température constante (4°C ± 3°C)

Incubateur (25°C ± 2°C)

Autoclave (121°C, 15 PSI)

Hotte à flux laminaire

4. RÉACTIFS

Eau stérile

Coloration de GRAM

Produits " Biolog »

Réactifs oxydase

Réactifs catalase

Huile à immersion

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Méthode analytique 341- Identification des bactéries cultivables

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5. ÉCHANTILLONNAGE

Non applicable

6. PROTOCOLE ANALYTIQUE

6.1 Faire le repiquage, en culture pure, de toutes les colonies différentes retrouvées sur le pétri

d'origine.

6.2 Confirmer la pureté de la colonie au stéréomicroscope. Si une culture mixte est identifiée, il faut

tenter à nouveau l'isolement des colonies présentes. Il faut s'assurer de ne pas doubler

l'identification d'un isolement déjà réalisé à partir du pétri de départ. Bien comp

arer les repiquages avec la colonie de départ.

6.3 D'autres milieux de culture peuvent être utilisés pour faciliter l'identification de certains genres.

6.4 Pour chaque colonie isolée en culture pure, vérifier les caractéristiques macroscopiques de la

colonie (dimension, couleur, texture, pigmentation du milieu, etc.).

6.5 Un montage humide effectué à l'aide de l'eau peptonée permet de vérifier les caractéristiques

microscopiques de la bactérie décrites dans les livres de réfé rence 2-3

6.6 Un test d'oxydase permet de vérifier la présence du cytochrome C caractéristique à certains

genres bactériens.

6.7 Une coloration de Gram permet de différencier entre les bactéries à Gram positif et celles à Gram

négatif.

6.8 Selon les résultats des tests biochimiques, faire une analyse du profil en acide gras ou une

analyse par tests biochimiques, tel que décrit ci-dessous :

6.8.1 En présence d'un Gram positif ou d'un Gram négatif à l'oxidase positive, effectuer

l'analyse du profil en acides gras selon la méthode IRSST 344.

6.8.2 En présence d'un Gram négatif à l'oxidase négative, effectuer une identification à partir

des plaques d'identification de BIOLOG ou Microscan ou d'autres systèmes d'identification pour vérifier les caractéristiques biochimiques de la souche à identifier. Effectuer une inoculation des plaques en suivant les recommandations du manufacturier pour inoculer, et lire les réactions biochimiques 4

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Méthode analytique 341- Identification des bactéries cultivables

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7. PARAMÈTRES D'APPLICATION

7.1 Limite de détection et limite de quantification

Non applicable

7.2 Fidélité Non applicable

7.3 Exactitude Non applicable

7.4 Incertitude de mesure Non applicable

8. CONTRÔLE DE QUALITÉ

8.1 Contrôle inter laboratoire

Un contrôle de qualité interlaboratoires est effectué avec l'AIHA (American Industrial Hygiene

Association). Les échantillons sont acheminés au laboratoire à trois reprises à chaque année.

Chaque série d'échantillons contient au moins trois inconnus de bactéries qui nous proviennent

sous forme lyophilisée. Dans certains envois, des échantillons d'eau ou de poussières contenant

une ou plusieurs bactéries doivent également être traités.

8.2 Contrôle des produits utilisés

8.2.1 Un contrôle de qualité est effectué pour chaque coloration de Gram. Les lames utilisées

pour réaliser les colorations de Gram sont inoculées avec une bactérie à Gram positif et une à Gram négatif. La coloration obtenue doit correspondre à c elle attendue.

8.2.2 Un contrôle de qualité est réalisé sur les plaques d'identification BIOLOG ou autres pour

chaque nouveau lot reçu. Des souches pour contrôle de qualité sont inoculées dans les plaques d'identification respectives. Les réactions biochimiques sont connues pour ces microorganismes et les résultats doiv ent correspondre aux réactions attendues.

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9. SANTÉ ET SÉCURITÉ

9.1 Déversement mineur :

Lors d'un petit déversement (quelques pétris) de microorganismes, le technicien doit mettre un

produit désinfectant (alcool, eau de javel...) sur la surface contaminée. Recouvrir ensuite, puis

quitter le laboratoire pendant env iron trente (30) minutes pour que les particules se déposent.

Mettre une affiche sur la porte du laboratoire afin d'en limiter l'accès si nécessaire. Après ce

trente minutes, bien nettoyer la surface. Il faut autoclaver tout le matériel qui a été en contact

avec le contaminant.

9.2 Déversement majeur :

Lors d'un gros déversement (plusieurs pétris), le technicien doit sortir du laboratoire, mettre une

affiche sur la porte pour limiter l'accès au laboratoire, puis aviser le professionnel responsable

et

son supérieur. Après 30 minutes d'attente pour que les particules se soient déposées, il faut

mettre un produit désinfectant (alcool, eau de javel ...) sur la surface contaminée et recouvrir

pour laisser agir. Après une trentaine de minutes, bien nettoyer la surface contaminée. Il faut

autoclaver tout le matériel qui a été en contact avec le contam inant. Le port d'un masque N-95 est nécessaire lors du nettoyage . Selon l'ampleur du déversement, le professionnel responsable pourrait demander que toute les surfaces (murs, comptoirs, béchers...) ayant possiblement été en contact avec le contaminant soient décontaminées.

10. RÉFÉRENCES

1. Microbial Identification System, Operating manual, Version 6, MIDI Inc., Newark, Delaware, 1998.

2. Bergey's Manual of Determinative Bacteriology, Holt J.G., Krieg, N.R., Sneath, P.H.A., Staley, J.T.

et Williams, S.T., Ninth edition, Williams & Wilkins, Baltimore, 1994.

3. Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, Murray, R.G.E., Brenner, J.D., Bryant, M.P., Holt,

G.J., Krieg, R.N., Moulder, J.W., Pfennig, N., Sneath, P.H.A., Staley, J.T., Mair, N.S., Sharpe, M.E.

et Williams, S.T., vol 1 et 2, Williams & Wilkins, Baltimore, 1986.

4. Manuel d'utilisation des plaques d'identification et manuel contrôle de qualité, BIOLOG.

11. BIBLIOGRAPHIE

1. Microbiological Methods, Collins, C.H., Sixth Edition, Butterworths, London. 409p. 1989.

2. Assessing Bioaerosols in Indoor Environment Workshop, sponsored by the University of Michigan

and ACGIH, Oct. 4-6 1988, Ann Arbor, Michigan.quotesdbs_dbs5.pdfusesText_9
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