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Rebecca XICLUNA
THESE DE DOCTORAT DE
L'UNIVERSITE DE NANTES
COMUE UNIVERSITE BRETAGNE LOIRE
ECOLEDOCTORALE N° 605
BIOLOGIE SANTE
SPECIALITE : IMMUNOLOGIE
ParRebecca XICLUNA
Etude de la réponse immunitaire virale préexistante anti-AAV chez l'homme. Thèse présentée et soutenue à Nantes, le 12/12/2019Unité de recherche : Inserm UMR1089
Rapporteurs avant soutenance :
Federico MINGOZZI Directeur de Recherche, INSERM UMR 951 Anna SALVETTI Directeur de Recherche, INSERM U1052 CNRS UMR5286Composition du Jury :
Président : Ignacio ANEGON Directeur de Recherche , INSERM UMR1064 Dir. de thèse : Oumeya ADJALI Chargé de Recherche, INSERM UMR1089 2 3 dans cette thèse.accepté de faire partie de mon jury de thèse. Je les remercie également pour leur analyse et
leurs commentaires avisés de mon manuscrit.Je remerc
participé à mes comités de suivi de thèse ainsi que pour leurs conseils et leurs
encouragements. Merci au Dr Xavier Saulquin et à Jeanne Perroteau pour leur aide sur la technologie des tétramères, sur la génération des lignées de lymphocytes T. et fait découvrir le monde de la recherche et . Elles ont fait de cette première expérience de recherche un très bon souvenir. Parce que sans eux cette thèse ne se serais surement pas aussi bien passé, un très très très grand merci à toute la team Immuno ! -Un grand . Merci pour tes précieux con !) et surtout pour ta bonne humeur.formée, préparée le terrain, lancée dans cette thèse et surtout pour avoir continué à me fournir
une aide précieuse depuis la Finlande. -Merci à Marie ses potins et ses grands éclats de rire dans les couloirs et surtout merci pour ce merveilleuxété attribué grâce à toi.
- pour ton aide et tes conseils ainsi 4 -Merci à Alicia pour sa participatioet de tétramères pendant plus de 3 ans , pour leurs conseils et pour les nombreuses réunions
immuno délirantes: Virginie, Célia, Malo, Sam, Johanne, Estelle, pu voir défiler et surtout à notre chère mascotte Martine ! toujours été un plaisir de travailler avec vous. Merci au personnel des plateformes de la SFR, en particulier à la plateforme Cytocell, Juliette et Nadège, la plateforme P2R, mais également Micropicell pour leur aide et leurs conseils. Merci également au CPV qui a produits nos lots de vecteurs AAVr. Merci à toute les membres de (les actuels et les anciens !) et particulièrement à Anita et Manuela pour toute la gestion administrative mais aussi à Charlène et Cynthia qui nous permettent au quotidien de maniper dans les meilleurs conditions (et surtout pour avoir fortement contribué à notre collection de Monsieur Madame). leurs conseils, leurs suggestions et leurs corrections : Céline, Mickaël, Magalie, Virginie et Mia. !), Audrey et Malo, qui ont été en première ! Un énorme merci à Audrey pour ces 3 années de vie commune et de symbiose dans le bureau404. Grâce à toi cette thèse est surtout remplie de plein plein de très bons souvenirs (que je ne
listerai pas sinon il faudrait un chapitre en plus). Encore merci pour le soutien que tu apporté. Merci également à notre nouvelle coloc de bureau, Marianne qui a su apporté de la bonne humeur (et des gaufrettes) au sein du bureau des thésardes aigries. ette thèse et même de e sur la fin : Merci à mes parents, Bren, mes cousines, Nini, Manu, Cindy, Marine, Chloé, Julie, Victoire, Alex, Guigui et. tous les autres ! 5Remerciements ............................................................................................................... 3
Table des matières .......................................................................................................... 5
Illustrations ..................................................................................................................... 9
Figures ........................................................................................................................ 9
Tableaux .................................................................................................................... 11
Abréviations ................................................................................................................. 13
Avant-propos ................................................................................................................ 17
INTRODUCTION ........................................................................................................ 21
Partie 1 : La thérapie génique et les stratégies de vectorologie ................................ 21
Partie 2 : Le virus adéno-associé et ses vecteurs dérivés .......................................... 25
I. .............................................................................................. 25
A. Le génome de l'AAV sauvage.................................................................... 26
B. Les sérotypes naturels de l'AAV ................................................................ 29
C. .................................................................. 311) Internalisation et transport du virus dans la cellule ............................... 31
2) .............................................. 33
3) ................................................................................... 37
......................................................................................... 38 A. ............................................................................... 39 B. La ................................................................................ 40 C. ........................................................................... 42 D. ................................................................ 44 ................................................. 47 I. ........................................................................................... 48A. Généralités et reconnaissance virale .......................................................... 48
6 B. ....................................................................... 511) Reconnaissance du génome virale ......................................................... 52
2) Reconnaissance de la capside virale ...................................................... 54
II. ................................................................................ 55 A. Capture des antigènes et présentation aux lymphocytes ............................ 561) Généralités ............................................................................................. 56
2) ................................... 58
B. ............................................................... 591) Généralités ............................................................................................. 59
2) -AAV ......................................... 61
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