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Activité : LA GEOMETRIE DES MOLECULES
I-Objectifs : Recherche d'une méthode simple pour prévoir la géométrie d'une molécule en
connaissant sa structure électronique et à l'aide d'un logiciel de simulation : Microméga.II-Mise en marche du simulateur
1-Allumer l'ordinateur. A partir du bureau, double cliquer sur " PHYSIQUE CHIMIE SECONDE ».
2-Dans CHIMIE sélectionner " simulateur et banque de données ». Choisir " Lewis : représentation de
Lewis » dans ce simulateur.
III-Construction et l'étude quelques molécules1-Dans la fenêtre " animation » placer le curseur de la vitesse sur le 4e niveau à partir du bas. La
géométrie réelle de la molécule apparaîtra dans cette fenêtre, si la construction est juste. Si la
molécule n'apparaît pas, il faut vérifier les atomes, leur nombre ou le nombre des liaisons entre les
atomes. Cocher l'onglet géométrie dans cette fenêtre.2-Donner les structures électroniques des atomes de carbone, hydrogène, oxygène et azote puis
rappeler le nombre de liaisons que peuvent établir ces atomes en justifiant.C (Z = 6) :
H (Z=1) :
O (Z = 8) :
N (Z = 7) :
3-Proposer alors une formule développée et l'écrire dans le tableau ci-dessous, pour les molécules
H2O, CH4, et NH3
4-Vérifier les formules développées proposées et donner la géométrie des molécules étudiées en les
construisant dans la fenêtre " dessiner » du logiciel de simulation. Pour ceci cliquer et maintenir
appuyé le bouton gauche de la souris sur chaque atome, et le déplacer dans le cadre blanc puislâcher le bouton. Utiliser, pour cela, à chaque fois une nouvelle page dans la fenêtre " dessiner »
numérotées respectivement 1, 2, 3, etc. Compléter la colonne " géométrie » et " schéma de Lewis » du tableau :NomFormule
bruteFormule développéeSchéma de LewisGéométrieEauH2O
MéthaneCH4
AmmoniacNH3
5-La représentation de Cram d'une molécule permet sa présentation dans l'espace à trois
dimensions : elle fait apparaître les liaisons en perspective. iUne liaison dans le plan est symbolisée par un trait plein : iUne liaison en avant du plan est symbolisée par : iUne liaison en arrière du plan est symbolisée par :En vous aidant des modèles moléculaires, dessiner la représentation de Cram des molécules de
méthane et d'ammoniac en complétant le tableau suivant : NomFormule bruteFormule développéeReprésentation de CramAmmoniacNH3
MéthaneCH4
6-Colorer les doublets liants et non liants en cochant les cases correspondant dans la fenêtre
" schéma de Lewis » du logiciel. En tenant copte de ces doublets, émettre une hypothèse qui
expliquerait la géométrie des molécules étudiées.7-Proposer des formules de Lewis des molécules O2 , CO2 , N2 , HCN et C2H4 sur un brouillon et
vérifier la réponse en les construisant à l'aide du logiciel. Si une molécule n'apparaît pas dans la
fenêtre " Animation » vérifier le nombre de liaisons que chaque atome de la molécule peut établir.
Remarque : Le logiciel permet de modifier les liaisons entre les atomes en cliquant droit sur lesatomes concernés puis choisissant le nombre de liaisons désiré. Compléter le tableau suivant :
NomFormule bruteSchéma de LewisGéométrie
Dioxyde de
carboneCO2DioxygèneO2
DiazoteN2
Cyanure
d'hydrogèneHCNEthèneC2H4
Conclusion : lorsque le carbone établit .......... liaisons avec .......... autres atomes, sa géométrie
est tétraédrique. Dans d'autres cas sa géométrie est ....................... ou ..........................
IV-La géométrie des carbones dans un acide aminé Les acides aminés sont les briques fondamentales à partir desquelles sont élaborés tous les êtres vivants. La glycine (anciennement appelée glycocolle) ou acide aminoacétique est un acide-α-aminé. Combien de liaisons forme chaque atome de carbone de cette molécule, avec ses atomes voisins : C1 : ............................ , C2 : ................................ Donner la géométrie de chaque carbone ainsi que celle de l'atome d'azote dans la molécule de glycine. C1 : ........................... ; C2 : ...........................;N : ...........................
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