[PDF] Etat davancement des travaux de thèse de doctorat : Année I

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ETAT D'AVANCEMENT DES TRAVAUy

DE THÈSE DE DOCTORAT

PRNÓIÈRN ANNÉN

Eugène NIYONZIMA

Laboratoire Analyses, Qualité et Sécurité des Produits Agroalimentaires UniWé AnalyVeVH QualiWé eW RiVqueV; ULg-GxABT Plan

1.RéTacWion Tu proWocole Te recUercUe

2.Revue Te la liWWéraWure eW réTacWion Te

l'article de synthğse

3.ŃormaWion TocWorale

Evaluation du risque de Salmonella Vpp. dans la

filière vianTe bovine au RwanTa eW éWuTe TeV facteurs de maîtrise

Contedžte d'Ġtude

Contedžte d'Ġtude

Superficie:

26.338 km²

Population:

10.624.000Uab (*).

Densité:

403H37Uab.Ikm2

zzzzzzzzzzzzzzz

YYYYYYYYYYYYYYY

YYYYYYYYYYYYYYY

YY

YYYYYYY

Rép.Dém.

Tu Congo

Tanzanie

Ouganda

Burundi

aaaaaaaaaaaaa aaaaaaaaaaaaa aaaaaaaaaaaaa aaaaaaa

Province

de l'Est

Province

du Nord

Province

Te l'Ouest

Province

Tu SuT

XXKIGALI

Rwanda: Carte administrative

(*) NISR, 2012

Contedžte d'Ġtude

Elevage au Rwanda

Rôle économique

Agriculture: 33 % du PIB.

Elevage : 26 % du PIB agricole soit 8 % du PIB

national

Production de la viande

Viande bovine: 50% de la production annuelle

en viande. (FAOSTAT,2012)

Contedžte d'Ġtude

Rwanda:

Evolution du cheptel bovin

SourceJ ŃAOSTATH2012

Rwanda:

Production de la viande bovine

SourceJ ŃAOSTATH2012

Millions de têtes de bovinsÓillierV Te WonneV Te vianTe

Contedžte d'Ġtude

Qualité microbiologique de la viande

Contaminations dans les marchés (HirwaH 2010)

100 %non-conformiWéJ bacWérieV aérobieV

(Niveau Te conWaminaWion L5.106ufcIg).

74 %non-conformiWéV J E. coli (>500 ufcIg)

Contaminations dans unabattoir (Bora, 2011)

100 %non-conf.J bacWérieV aérobieV (L5.0 log ufcIg)

100 %non-conf.J enWérobacWérieV (L2.5 log ufcIg)

Contedžte d'Ġtude

Qualité microbiologique de la viande

Aucune étude réalisée pour la recherche des bactéries pathogènesassociées à la contamination fécale comme Salmonella

Salmonelloses humaines (RBC, 2012)

Prévalence : 5 % (S.Thyphi)

Salmonellose non-WUypUoïTienneJ???

Viande bovine vs Salmonella(GreigeW al.H 2009)

Salmonella: 27.5 % des cas de TIAC dont la viande bovine est la source.

Objectif général

Etudier les sources de contamination de la viande

bovine par Salmonella Vpp. ă partir de l'abattoir microbiologique reflétant autant que possible la cUaîne Te proTucWion Te vianTe bovine au RwanTa

Objectifs spécifiques

1.CollecWer eW analyVer leV facWeurV Te riVque Te

conWaminaWion Te la vianTe bovine par Salmonella Vpp. dans les abaWWoirVH aWelierV Te Técoupe eW boucUerieV.

2.Nvaluer le riVque Te la ValmonelloVe aVVocié à la

consommation de la viande bovine dans la population rwandaise. Salmonella Vpp.dans la filière de production de la viande bovine.

4.TeVWer à WraverV le moTèle conVWruiWH TeV VWraWégieV Te

réTucWion Tu riVque Te Salmonella spp.

Collecte des

Ġchantillons d'analyses

Conduite des enquêtes

Abattoirs

Técoupe

au laboratoire

Conception du modèle

d'AYRM Evaluation quantitative du risque (Salmonella Vpp) AnalyVe Te VWraWégieV Te réTucWion Tu riVque

Matériel et Méthodes

Description de la zone d'Ġtude

Ville de Kigali.

Forte démographie: 10 % de la population

rwandaise. Présence des plus grandes unités de préparation de la vianTe bovine.

2 abattoirs bovins

3 ateliers de découpe

3 marchés centraux

Matériel et Méthodes

Plan d'Ġchantillonnage

Taille de l'Ġchantillon͗ Win Episcope 2.0

(Thrusfield et al., 2001)

Matériel et Méthodes

Plan d'Ġchantillonnage

Taille de l'Ġchantillon͗ Win Episcope 2.0

Prévalences

aWWenTueVJ -43% abaWWoirV -87% TiVWribuWion (SWevenV et al.,2006)

Sénégal

Matériel et Méthodes

Plan d'Ġchantillonnage

Unités de préparation de viandes

Type d'unitĠ Nombred'unitĠs

enregistrées

Nombre d'unitĠs

choisies

Abattoirs22

At. de découpe33

Boucheries12373

TOTAL12979

Matériel et Méthodes

Plan d'Ġchantillonnage

Nombre d'Ġchantillons ă prĠleǀer

Règlement (CE) 2073: 2005

Type d'unitĠsFréquenceDurée

(Sem.)

Nombre

d'Ġchant. Total

Abattoirs1/ Sem.105100

Ateliers 1/ Sem.105150

Boucheries1/ Sem.52730

Matériel et Méthodes

Analyses microbiologiques

Méthodes de prélèvement

Abattoirs:

Ecouvillonnage de 4 surfaces

Distribution:

Prélèvement de 25 g.

RèglemenW Nuropéen

(CN) 2073J 2005

Matériel et Méthodes

Analyses microbiologiques

Germes recherchĠs et mĠthodes d'analyse

Germes recherchésMĠthode d'analyse

FMAT ISO 4833-1:2013

EnterobacteriaceaeISO 21528:2004

Escherichia coliISO 16649-2:2001

Salmonella spp.ISO 6579:2002

Matériel et Méthodes

Abattoirs, atelier de découpe et boucheries (*) Objectif: identifier les sources et des facteurs de contamination de la viande dans les établissements. Questionnaire à remplir avec le responsable qualité de l'Ġtablissement. Mesure des paramètres quantitatifs influençant la

Matériel et Méthodes

Consommateurs

Objectifs:

Identifier les habitudes des consommateurs

(préférences, méthode conservation à domicile et moTe Te préparaWion) Estimer la quantité de viande bovine sommée . Suivi des ménages de la ville de Kigali pendant une périoTe Te 3 moiV en uWiliVanW un queVWionnaire.

Matériel et Méthodes

Consommateurs

Nombre de ménages suivi (Israël et al., 2013) n: taille de l'Ġchantillon e: degré de précision

N: taille de la population (NISR, 2012)

Matériel et Méthodes

Consommateurs

Matériel et Méthodes

Consommateurs

Matériel et Méthodes

Consommateurs

Matériel et Méthodes

Consommateurs

Matériel et Méthodes

Evaluation du risque

Méthodologie proposée par la commission du

CoTex alimenWariuV. (CACH 2009)

1.ITenWificaWion Tu Tanger

2.CaracWériVaWion Tu Tanger

3.Eǀaluation de l'edžposition

4.CaracWériVaWion Tu riVque

Matériel et Méthodes

Conception du modğle d' AYRM

Source des donnée:

RĠsultats d'analyses, informations collectĠes au cours de enquêtes et la littérature disponible.

Modèle comportera 4 modules:

1. Abattage des bovins, 2. Transport des carcasses et

TécoupeH 3. MiVWribuWion eW VWockage eW 4. ConVervaWion eW préparaWion à Tomicile.

Moyens utilisés

Microsoft Excel complété par le module Palissade@Risk

Déroulement des activités

PériodeSiteActivités

Mai 2013

Février2014GxABT-ULg

1.Préparation du protocole de recherche

2.Reǀue de la littĠrature et prĠparation de l'article

de synthèse (Publication N°1)

3.Elaboration du plan d'échantillonnage

4.Préparation et validation des questionnaires

5.SĠlection et ǀalidation des mĠthodes d'analyse

Mars 2014

Août 2014

KIST

RWANDA

1.Collecte des échantillons dans les abattoirs et

ateliers de découpe et conduite des analyses de laboratoire

2.Conduite des enquêtes auprès des

consommateurs

3.RĠdaction du rapport sur l'Ġtat d'aǀancement

Déroulement des activités

PériodeSiteActivités

Sept.2014

Février 2015GxABT-ULg

1.Sérotypage des souches

2.Présentation du rapport

3.Suivi de cours (Formation doctorale)

des abattoirs(Publication N°2)

Mars 2015

Août 2015

KIST

RWANDA

1.Collecte des échantillons dans les boucheries et

conduite des analyses de laboratoire.

2.RĠdaction du rapport sur l'Ġtat d'aǀancement

Sept.2015

Février 2016GxABT-ULg

1.Sérotypage des souches

2.Présentation du rapport

découpe et boucheries (Publication N°3)

Déroulement des activités

PériodeSiteActivités

Mars 2016

Août 2016

KIST

RWANDA

2.Conception du modğle d'Ġǀaluation

quantitative du risque et analyse des scenariosquotesdbs_dbs4.pdfusesText_8

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