[PDF] T. D. n 8 Exemples classiques de dispositifs expérimentaux





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Comment faire une ANOVA avec plusieurs échantillons ?

Si il n'y a qu'1 seul facteur, on parle de One-way ANOVA. Si il y a 2 facteurs, on parle de Two-way ANOVA (ou MANOVA), on teste alors l'effet de ces 2 facteurs en même temps. On peut modéliser unt Two-way ANOVA de 2 facons : si il y a ou non une interaction entre les facteurs.

Quels sont les paramètres de l’Anova ?

Les paramètres que l’on va utiliser en ANOVA vont représenter des effets particuliers du modèle pris en compte : effet général et effets principaux des niveaux du facteur dans un plan à un seul facteur; effet général, effets princi- paux des niveaux de chaque facteur et effets d’interactions dans un plan à deux facteurs

Frédéric BertrandMaster 1reAnnée - 2012/2013T. D. n o8 Exemples classiques de dispositifsexpérimentaux -Exercice 1, 2 :ANOVA 1F -Exercice 3 :ANOVA 1F et transformations stabilisatrice de variance. -Exercice 4, 5, 6 :Plan en blocs complets -Exercice 7, 8, 9, 10, 11, 12 :Deux facteurs croisés -Exercice 8 :Deux facteurs blocs croisés -Exercice 13 :Deux facteurs déséquilibrés. Plan non-orthogonal. -Exercice 14 :Deux facteurs croisés avec un facteur bloc. -Exercice 15, 16 :Trois facteurs croisés -Exercice 17 :Deux facteurs emboités. -Exercice 18, 19, 20 :ANOVA 1F à mesures répétées. -Exercice 21, 22, 23, 24 :ANOVA 2F à mesures répétées (I). -Exercice 25, 26 :ANOVA 2F à mesures répétées (II). -Exercice 27 :Split plot avec répétitions. Exercice 1. Un facteur.D"après Prum.Modèle linéaire. Comparaison de groupes et régression.Les éditions INSERM, 1996. Nous souhaitons comparer trois traitements, notésA,BetCcontre l"asthme : le traitementBest un nouveau traitement, que nous souhaitons mettre en compétition avec les traitements classiquesAetC. Nous répartissons par tirage au sort les patients venant consulter dans un centre de soin, et nous leur affectons l"un des trois traitements. Nous mesurons sur chaque patient la durée, en jours, séparant de la

prochaine crise d"asthme. Les mesures sont reportées dans le tableau ci-dessous :TraitementATraitementBTraitementC26;27;35;3629;42;44;4426;26;30;30

38;38;41;4245;48;48;5233;36;38;38

45;50;6556;56;58;5839;46;47;51

60;61;63;6351;56;75

69
Pouvons-nous conclure que les traitements ont une efficacité différente pour le critère " temps séparant la prochaine crise? »

1.Écrire le modèle statistique de l"analyse de la variance à un facteur à effets

fixes.

2.Quelles sont les conditions d"utilisation du modèle d"analyse de la variance

précédent? Sont-elles vérifiées?1

Frédéric BertrandMaster 1reAnnée - 2012/20133.Donner, à l"aide du logiciel SAS, le tableau de l"ANOVA correspondant à

cette étude.

5.Réaliser le test de Fisher au seuil de significativité5%puis de1%. Qu"est-il

possible d"en déduire?

6.Donner une estimation de la variance2.

7.Dans le cas de cette étude, est-il possible de procéder à des comparaisons

multiples? Pourquoi? Si oui, réaliser alors ces comparaisons. Exercice 2. Un facteur.D"après Husson et Pagès.Statistiques générales pour utilisateurs : Tome 2, Exercices et corrigés.Presses Universitaires de Rennes, 2005. Le transport d"animaux d"élevage implique une succession de manipulations et de confinements qui, inévitablement, sont responsables de stress. L"objectif de cette étude est d"examiner le comportement des animaux lors de transports de longue durée. Pour mesurer le niveau de stress, nous avons calculé le pourcentage de temps que les animaux passent couchés. La fatigue des animaux (et donc le stress) est d"autant plus grande que le temps passé couché est important. L"expérimentation a consisté à observer 18 veaux transportés de France en Italie, la durée du voyage étant de 29 heures. Trois traitements ont été proposés durant la pause : - Traitement1: les veaux ne reçoivent ni eau ni aliment à la pause. - Traitement2: les veaux reçoivent de l"eau et sont alimentés à la pause par deux abreuvoirs. - Traitement3: les veaux reçoivent de l"eau et sont alimentés à la pause par cinq abreuvoirs. Pour enregistrer les comportements des animaux, la bétaillère est équipée de cameras et chaque animal est individualisé par un signe distinctif sur la peau. Les cassettes

vidéo ont été dépouillées à l"aide d"un logiciel. Les données sont disponibles dans le

tableau ci-dessous.Traitement117,4020,0026,7031,7035,8047,80

Traitement214,6537,2237,7343,6146,0747,40

Traitement318,7619,4927,1945,4253,2061,27

1.Pourquoi faut-il faire ici une analyse de la variance à un facteur et non pas

une analyse de la régression linéaire simple?

2.Écrire le modèle statistique de l"analyse de la variance à un facteur à effets

fixes.

3.Quelles sont les conditions d"utilisation du modèle d"analyse de la variance

précédent? Sont-elles vérifiées?

4.Donner, à l"aide d"un logiciel, le tableau de l"ANOVA correspondant à cette

étude.

5.Réaliser le test de Fisher au seuil de significativité5%puis de1%. Qu"est-il

possible d"en déduire?2 Frédéric BertrandMaster 1reAnnée - 2012/20136.Donner une estimation de la variance2.

7.Dans le cas de cette étude, est-il possible de procéder à des comparaisons

multiples? Pourquoi? Si oui, réaliser alors ces comparaisons. Exercice 3. Transformation.D"après Parreins.Techniques statistiques, moyens rationnels de choix et de décision.Dunod technique, 1974. Nous irradions des espèces vivantes avec des doses croissantes de rayons X, exprimées en roentgens, et nous calculons le pourcentage de décès. Les résultats expérimentaux

ont été reportés dans le tableau suivant :Dose0Dose500Dose1000Dose2000Dose30002;55;010;030;046;52;74;56;527;041;02;53;58;026;043;01.Écrire le modèle statistique de l"analyse de la variance à un facteur à effets

fixes.

2.Quelles sont les conditions d"utilisation du modèle d"analyse de la variance

précédent? Sont-elles vérifiées? En quoi cela est-il limitant?

3.Pour stabiliser la variance, transformer les données en utilisant la fonction

suivante : (x) = arcsinpx qui convertit les pourcentages en degrés. Justifier l"utilisation de cette trans- formation en introduisant(Xn)n2Nune suite de variables aléatoires telle que, pour toutn2N,Xnsuit une loi binomialeB(n;p)avecn2Netp2]0;1[ et en appliquant la méthode.

4.Déterminer alors s"il existe un effet de la dose de rayons X sur la variable

calculée en4.. Exercice 4. Plan en blocs complets.D"après G. Parreins.Techniques Statis- tiques : moyens rationnels de choix et de décision.Dunod technique, 1974. Nous voulons tester quatre types de carburateurs :A1,A2,A3etA4. Pour chaque type de carburateur nous disposons de six pièces qui sont montées successivement en parallèle sur quatre voitures que nous supposons avoir des caractéristiques par- faitement identiques. Le tableau ci-dessous indique pour chacun des essais la valeur d"un paramètre lié à la consommation :EssaiA 1A 2A 3A

4121231820

224231921

325322825

420231915

534322429

61715149

3

Frédéric BertrandMaster 1reAnnée - 2012/2013Nous décidonsde tenir comptede la possible influence de l"ordre de réalisation

des essais, c"est-à-dire du facteurEssai.

1. Proposer une méthode statistique permettant d"étudier conjointement l"in-

fluence du facteurCarburateuret du facteurEssaisur la consommation. Énoncer le modèle et les hypothèses nécessaires au modèle que vous projetez d"utiliser. Ce modèle comporte-t-il des répétitions?

2. Il y a-t-il des différences entre les carburateurs? Il y a-t-il des différences dues

au facteur bloc essais?

3. Quelles sont les estimations des paramètres du modèle? Si nécessaire et si

possible, comparer les différents niveaux du facteurCarburateurainsi que les différents niveaux du facteurEssai. Exercice 5. Plan en blocs complets.D"après Husson et Pagès.Statistiques gé- nérales pour utilisateurs : Tome 2, Exercices et corrigés.Presses Universitaires de

Rennes, 2005.

Parmi trois variétés de blé, quelle est celle qui donne le meilleur rendement? Pour répondre à cette question, on met en culture ces trois variétés, sur trois parcelles distinctes. Chaque parcelle est divisée en trois sous-parcelles, et ainsi chaque variété est cultivée sur chaque parcelle. Les apports d"engrais azoté, de fongicide et d"insec- ticide sont les mêmes et sont considérés comme optimaux pour chaque variété. Les mesures ont été reportées dans le tableau ci-dessous.

Le sol de chaque parcelle est censé être de même qualité mais on préfère le vérifier

en prenant en compte un effet parcelle dans le modèle d"analyse de la variance. Ce type d"effet est appelé " effet bloc ». On ne s"intéresse pas à cet effet, mais on le prend en compte dans l"analyse de la variance pour mieux mettre en évidence les éventuels effets des autres effets.Parcelle (bloc)VariétéRendement

1A61,00

2A70,92

3A55,94

1L70,80

2L66,44

3L68,12

1M55,30

2M57,30

3M54,39

1. Pourquoi la prise en compte de l"effet bloc peut-elle être utile pour conclure

à un éventuel effet variété?4

Frédéric BertrandMaster 1reAnnée - 2012/20132. Y a-t-il un effet variété au niveau de confiance de 5%? On supprime l"effet

bloc de l"analyse.

3. Pour quelle raison, en pratique, pourrait-on effectuer cette suppression? Cons-

truire le tableau d"analyse de la variance à un facteur (le facteur variété).

4. Construire le test global de significativité de l"effet variété. Comment expliquez-

vous que le test devienne significatif? Exercice 6. Plan en blocs complets.Viennoiseries. Y. Dodge.Analyse de ré- gression appliquée.Éditions Dunod, 1999. Pendant la cuisson, les croissants absorbent la graisse en quantité variable. Nous avons relevé la quantité de graisse absorbée lors de la cuisson de six fournées de croissantes pour quatre types de graisse. Les mesures sont présentées dans le tableau ci-dessous.Fournée/Graisse1 2 3 4

164 78 75 55

272 91 93 66

368 97 78 49

477 82 71 64

556 85 63 70

695 77 76 68

1. Quels sont les modèles que vous pouvez utiliser pour analyser ces données?

Pour chacun d"entre eux, détailler les hypothèses testées.

2. Nous nous intéressons uniquement à ces quatre types de graisse. Par contre,

nous cherchons à savoir si il y a un effet des fournées en général sur la quantité de graisse utilisée. Pour cela, quel est donc le modèle à choisir parmi les trois précédents? Nous allons maintenant travailler avec le modèle que nous venons de choisir.

3. Vérifier que les conditions d"application de l"ANOVA II sont vérifiées.

4. Construire, avec l"aide de MINITAB, le tableau d"analyse de la variance pour

ce modèle.

5. La fournée a-t-elle un effet significatif sur la quantité de graisse absorbée?

Écrire explicitement les hypothèses nulle et alternative de votre test et justi- fiez votre réponse.

6. La graisse a-t-elle un effet significatif sur la quantité de graisse absorbée?

Écrire explicitement les hypothèses nulle et alternative de votre test et justi- fiez votre réponse.

7. Calculer2. Que concluez-vous?

8. Évaluer la puissance dans chacun des tests du tableau de l"ANOVA II.

9. Quelles sont les comparaisons multiples que vous pouvez réaliser? Réaliser-les

et analyser-les. 5

Frédéric BertrandMaster 1reAnnée - 2012/2013Exercice 7. Deux facteurs croisés.D"après B. Falissard.Comprendre et utiliser

les statistiques dans les sciences de la vie.Masson, 2005. Nous testons l"influence de différents régimes alimentaires sur des rats de laboratoire. Le gain de poids des rats est désigné par la variablePoids, exprimée en grammes, les deux facteurs sont les variablesCalorieetV itamine. La variableCalorievaut

1 si les rats n"ont pas suivi un régime hypercalorique et 2 s"ils ont suivi un tel

régime hypercalorique. La variableV itaminevaut 1 si les rats n"ont pas reçu de

compléments vitaminés et 2 s"ils ont reçu de tels compléments.CalorieVitaminePoidsCalorieVitaminePoids

11841166

12621259

21872189

221032290

11661156

12841274

219221101

2210722116

11821179

12731274

21772195

229522112

11621189

12751274

21882191

22962292

1. Quels modèles d"analyse de la variance à deux facteurs pouvez-vous utiliser

pour étudier ces données? Nous décidons de retenir, pour répondre aux ques- tions suivantes, le modèle le plus complet parmi ceux dont il est possible de se servir. Rappeler les hypothèses associées au modèle.

2. Procéder à l"étude à l"aide de SAS.

3. Quelles sont les estimations des paramètres du modèle?

4. Devons-nous réaliser des tests de comparaisons multiples? Si oui, pour quel(s)

facteur(s)? Le(s) faire. Exercice 8. Deux facteurs ou blocs croisés.Comparaison de l"évaluation de la résistance d"un même type de ciment. D"après H. Sahai et M. I. Ageel "The Analysis of Variance».6 Frédéric BertrandMaster 1reAnnée - 2012/2013Davies et Goldsmith

1ont récolté les données d"une expérience dont le but était

d"étudier les différentes sources de variabilité possibles de la résistance d"un ciment fabriqué à Portland. On noteYla variable associée à la résistance du ciment.

L"expérience s"est déroulée ainsi : plusieurs petits prélèvements d"un même type de

ciment ont été mélangés à de l"eau et travaillés par trois personnes différentes, les

" mélangeurs ». On a alors formé douze cubes à l"aide de chacune des préparations

des "mélangeurs». Puis on a donné ces 36 cubes à trois personnes chargées d"évaluer

leur résistance, les " casseurs ». La répartition des 36 cubes entre ces " casseurs » a été faite de telle sorte que chaque " casseur » reçoive quatre cubes provenant de chacune des préparations des " mélangeurs » soit douze cubes au total. Tous les tests de résistance ont été faits sur la même machine. L"objectif principal de cette expérience était d"étudier et de quantifier l"importance de la variabilité dans les tests de résistance qui pouvait provenir des différences individuelles entre les

" mélangeurs » et les " casseurs ». Les données ci-dessous, exprimées dans les unités

d"origine c"est-à-dire en livres par pouces carrés, ont été recopiées dans le tableau ci

dessous." Casseur » 1" Casseur » 2" Casseur » 3 " Mélangeur » 15280 55204340 44004160 5180

4760 58005020 62005320 4600

" Mélangeur » 24420 52805340 48804180 4800

5580 49004960 62004600 4480

" Mélangeur » 35360 61605720 47604460 4930

5680 55005620 55604680 5600

Partie I : deux facteurs fixes croisés

Dans l"expérience d"origine, on ne s"intéressait qu"aux différences ne pouvant être dues qu"à ces trois " mélangeurs » et à ces trois " casseurs ».

1. Écrire le modèle d"analyse de la variance relatif à cette étude. On précisera

la nature des facteurs explicatifs ainsi que les hypothèses faites.

2. Les hypothèses du modèle sont-elles vérifiées? Calculer les estimations de

tous les paramètres du modèle.

3. Existe-t-il une interaction dans l"évaluation de la résistance du ciment entre

les " mélangeurs » et les " casseurs »?

4. Existe-t-il des différences dans l"évaluation de la résistance dues aux " mélan-

geurs »?1. Davies, O.L. et Goldsmith, P.L. (Eds.),Statistical Methods in Research and Production, 4th

edition, Oliver and Boyd, Edinburgh, 1972.7

Frédéric BertrandMaster 1reAnnée - 2012/20135. Existe-t-il des différences dans l"évaluation de la résistance dues aux " cas-

seurs »?

6. Compte tenu de la nature des deux facteurs peut-on procéder à des compa-

raisons multiples? Il y a-t-il un facteur pour lequel cette procédure se justifie, si oui procéder aux tests correspondants.

Partie II : deux facteur blocs croisés

On souhaite désormais que les résultats de cette expérience ait une portée plus gé- nérale que celle de la première partie : on ne restreint plus l"étude à cette population de " casseurs » et de " mélangeurs ».

7. Écrire le modèle d"analyse de la variance relatif à cette étude. On précisera

la nature des facteurs explicatifs ainsi que les hypothèses faites.

8. Les hypothèses du modèle sont-elles vérifiées? Calculer les estimations de

tous les paramètres du modèle.

9. Existe-t-il une interaction dans l"évaluation de la résistance du ciment entre

les " mélangeurs » et les " casseurs »?

10. Existe-t-il des différences dans l"évaluation de la résistance dues aux " mélan-

geurs »?

11. Existe-t-il des différences dans l"évaluation de la résistance dues aux " cas-

seurs »? Exercice 9. Deux facteurs croisés.Activité d"une enzyme

L"étude de l"activité d"une enzyme a été réalisée chez des sujets jeunes en fonction

de l"âge et du sexe.

48 essais ont été réalisés dans des conditions similaires sur 48 individus distincts.

Leurs résultats, exprimés en unités arbitraires, ont été reproduits dans le tableau ci-dessous. 8 Frédéric BertrandMaster 1reAnnée - 2012/2013AgeSexeEnzymeAgeSexeEnzyme moins de 12 ansgarçon4,9plus de 12 ansgarçon2,1 moins de 12 ansgarçon2,9plus de 12 ansgarçon2,2 moins de 12 ansgarçon2,7plus de 12 ansgarçon1,1 moins de 12 ansgarçon3,9plus de 12 ansgarçon2,9 moins de 12 ansgarçon4,6plus de 12 ansgarçon5,0 moins de 12 ansgarçon3,3plus de 12 ansgarçon3,5 moins de 12 ansgarçon5,9plus de 12 ansgarçon2,4 moins de 12 ansgarçon4,8plus de 12 ansgarçon4,4 moins de 12 ansgarçon4,1plus de 12 ansgarçon2,1 moins de 12 ansgarçon3,5plus de 12 ansgarçon3,0 moins de 12 ansgarçon7,2plus de 12 ansgarçon3,9 moins de 12 ansgarçon6,1plus de 12 ansgarçon5,6 moins de 12 ansfille4,5plus de 12 ansfille2,4 moins de 12 ansfille6,9plus de 12 ansfille3,6 moins de 12 ansfille4,0plus de 12 ansfille4,8 moins de 12 ansfille5,4plus de 12 ansfille3,9 moins de 12 ansfille1,9plus de 12 ansfille5,5 moins de 12 ansfille3,6plus de 12 ansfille5,0 moins de 12 ansfille4,8plus de 12 ansfille6,8 moins de 12 ansfille3,3plus de 12 ansfille2,2 moins de 12 ansfille7,5plus de 12 ansfille3,1 moins de 12 ansfille5,8plus de 12 ansfille5,0 moins de 12 ansfille4,4plus de 12 ansfille4,1 moins de 12 ansfille6,0plus de 12 ansfille4,7

Partie I

I.1.Écrire le modèle d"analyse de la variance relatif au modèle dont les résultats sont reproduits dans la suite de lapartie I. On précisera la nature des facteurs explicatifs ainsi que les hypothèses faites. I.2.Les hypothèses du modèle sont-elles vérifiées? Calculer les estimations de tous les paramètres du modèle. I.3.Procéder à l"étude du tableau de l"analyse de la variance. I.4.Compte tenu de la nature des facteurs peut-on procéder à des comparaisons multiples? Il y a-t-il un facteur pour lequel cette procédure se justifie, si oui procéder aux tests correspondants et interpréter les résultats.

Partie II

II.1.Écrire le modèle d"analyse de la variance relatif au modèle dont les résultats sont reproduits ci-dessous. On précisera la nature des facteurs explicatifs ainsi que les hypothèses faites. II.2.Les hypothèses du modèle sont-elles vérifiées? Calculer les estimations de tous les paramètres du modèle. II.3.Procéder à l"étude du tableau de l"analyse de la variance.9

Frédéric BertrandMaster 1reAnnée - 2012/2013II.4.Compte tenu de la nature des facteurs peut-on procéder à des comparaisons

multiples? Il y a-t-il un facteur pour lequel cette procédure se justifie, si oui procéder aux tests correspondants et interpréter les résultats. II.5.En comparant les résultats obtenus dans cette seconde partie avec ceux de la première partie, que constatez-vous? Exercice 10. Deux facteurs croisés.Quatre modèles de machines à écrire. D"après

François Husson et Jérôme PagèsStatistiques générales pour utilisateurs, éditions

PUR. Une entreprise cherche à tester quatre modèles de machines à écrire. Pour faire ce test, elle demande à cinq secrétaires professionnelles de taper un texte pendant 5 minutes. À la fin du test, on compte le nombre moyen de mots tapés en une minute.

On répète l"expérience le lendemain.

Les résultats (nombre moyen de mots par minute) sont présentés dans le tableau au verso.Secrétaires

Machines à écrire1 2 3 4 5

133 31 34 34 31

36 31 36 33 31

232 37 40 33 35

35 35 36 36 36

337 35 34 31 37

39 35 37 35 40

429 31 33 31 33

31 33 34 27 33

Soit le modèle :

Y i;j;k=+i+j+ i;j+i;j;k aveci= 1;2;3;4,j= 1;2;3;4;5etk= 1;2et oùcorrespond à l"influence de la machine à écrire,l"influence de la secrétaire et l"interaction entre la machinei et la secrétairej.

1. Décrire le modèle, et ses conditions d"utilisation, qui permet de tester les trois

hypothèses nulles suivantes : (i) Que cherche-t-on à tester avec les deux hypothèses suivantes? H

0:1=2=3=4

contre H

1:les valeurs desine sont pas toutes égales,i= 1;2;3;4:

(ii) Que cherche-t-on à tester avec les deux hypothèses suivantes? H

0:1=2=3=4=5

contre H

1:les valeurs desjne sont pas toutes égales,j= 1;2;3;4;5:

10

Frédéric BertrandMaster 1reAnnée - 2012/2013(iii) Que cherche-t-on à tester avec les deux hypothèses suivantes?

H 0: 1;1= 1;2== 1;5= 2;1== 4;5 contre H

1:les valeurs des

i;jne sont pas toutes égales,i= 1;2;3;4etj= 1;2;3;4;5:

2. Décrire le modèle, et ses conditions d"utilisation, qui permet de tester les trois

hypothèses nulles suivantes : (i) Que cherche-t-on à tester avec les deux hypothèses suivantes? H

0:2A= 0

contre H

1:2A6= 0:

(ii) Que cherche-t-on à tester avec les deux hypothèses suivantes? H

0:2B= 0

contre H

1:2B6= 0:

(iii) Que cherche-t-on à tester avec les deux hypothèses suivantes? H

0:2AB= 0

contre H

1:2AB6= 0:

3. Décrire le modèle, et ses conditions d"utilisation, qui permet de tester les trois

hypothèses nulles suivantes : (i) Que cherche-t-on à tester avec les deux hypothèses suivantes? H

0:1=2=3=4

contre H

1:les valeurs desine sont pas toutes égales,i= 1;2;3;4:

(ii) Que cherche-t-on à tester avec les deux hypothèses suivantes? H

0:2B= 0

contre H

1:2B6= 0:

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