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Comment faire une ANOVA avec plusieurs échantillons ?
Si il n'y a qu'1 seul facteur, on parle de One-way ANOVA. Si il y a 2 facteurs, on parle de Two-way ANOVA (ou MANOVA), on teste alors l'effet de ces 2 facteurs en même temps. On peut modéliser unt Two-way ANOVA de 2 facons : si il y a ou non une interaction entre les facteurs.
Quels sont les paramètres de l’Anova ?
Les paramètres que l’on va utiliser en ANOVA vont représenter des effets particuliers du modèle pris en compte : effet général et effets principaux des niveaux du facteur dans un plan à un seul facteur; effet général, effets princi- paux des niveaux de chaque facteur et effets d’interactions dans un plan à deux facteurs
prochaine crise d"asthme. Les mesures sont reportées dans le tableau ci-dessous :TraitementATraitementBTraitementC26;27;35;3629;42;44;4426;26;30;30
38;38;41;4245;48;48;5233;36;38;38
45;50;6556;56;58;5839;46;47;51
60;61;63;6351;56;75
69Pouvons-nous conclure que les traitements ont une efficacité différente pour le critère " temps séparant la prochaine crise? »
1.Écrire le modèle statistique de l"analyse de la variance à un facteur à effets
fixes.2.Quelles sont les conditions d"utilisation du modèle d"analyse de la variance
précédent? Sont-elles vérifiées?1Frédéric BertrandMaster 1reAnnée - 2012/20133.Donner, à l"aide du logiciel SAS, le tableau de l"ANOVA correspondant à
cette étude.5.Réaliser le test de Fisher au seuil de significativité5%puis de1%. Qu"est-il
possible d"en déduire?6.Donner une estimation de la variance2.
7.Dans le cas de cette étude, est-il possible de procéder à des comparaisons
multiples? Pourquoi? Si oui, réaliser alors ces comparaisons. Exercice 2. Un facteur.D"après Husson et Pagès.Statistiques générales pour utilisateurs : Tome 2, Exercices et corrigés.Presses Universitaires de Rennes, 2005. Le transport d"animaux d"élevage implique une succession de manipulations et de confinements qui, inévitablement, sont responsables de stress. L"objectif de cette étude est d"examiner le comportement des animaux lors de transports de longue durée. Pour mesurer le niveau de stress, nous avons calculé le pourcentage de temps que les animaux passent couchés. La fatigue des animaux (et donc le stress) est d"autant plus grande que le temps passé couché est important. L"expérimentation a consisté à observer 18 veaux transportés de France en Italie, la durée du voyage étant de 29 heures. Trois traitements ont été proposés durant la pause : - Traitement1: les veaux ne reçoivent ni eau ni aliment à la pause. - Traitement2: les veaux reçoivent de l"eau et sont alimentés à la pause par deux abreuvoirs. - Traitement3: les veaux reçoivent de l"eau et sont alimentés à la pause par cinq abreuvoirs. Pour enregistrer les comportements des animaux, la bétaillère est équipée de cameras et chaque animal est individualisé par un signe distinctif sur la peau. Les cassettesvidéo ont été dépouillées à l"aide d"un logiciel. Les données sont disponibles dans le
tableau ci-dessous.Traitement117,4020,0026,7031,7035,8047,80Traitement214,6537,2237,7343,6146,0747,40
Traitement318,7619,4927,1945,4253,2061,27
1.Pourquoi faut-il faire ici une analyse de la variance à un facteur et non pas
une analyse de la régression linéaire simple?2.Écrire le modèle statistique de l"analyse de la variance à un facteur à effets
fixes.3.Quelles sont les conditions d"utilisation du modèle d"analyse de la variance
précédent? Sont-elles vérifiées?4.Donner, à l"aide d"un logiciel, le tableau de l"ANOVA correspondant à cette
étude.
5.Réaliser le test de Fisher au seuil de significativité5%puis de1%. Qu"est-il
possible d"en déduire?2 Frédéric BertrandMaster 1reAnnée - 2012/20136.Donner une estimation de la variance2.7.Dans le cas de cette étude, est-il possible de procéder à des comparaisons
multiples? Pourquoi? Si oui, réaliser alors ces comparaisons. Exercice 3. Transformation.D"après Parreins.Techniques statistiques, moyens rationnels de choix et de décision.Dunod technique, 1974. Nous irradions des espèces vivantes avec des doses croissantes de rayons X, exprimées en roentgens, et nous calculons le pourcentage de décès. Les résultats expérimentauxont été reportés dans le tableau suivant :Dose0Dose500Dose1000Dose2000Dose30002;55;010;030;046;52;74;56;527;041;02;53;58;026;043;01.Écrire le modèle statistique de l"analyse de la variance à un facteur à effets
fixes.2.Quelles sont les conditions d"utilisation du modèle d"analyse de la variance
précédent? Sont-elles vérifiées? En quoi cela est-il limitant?3.Pour stabiliser la variance, transformer les données en utilisant la fonction
suivante : (x) = arcsinpx qui convertit les pourcentages en degrés. Justifier l"utilisation de cette trans- formation en introduisant(Xn)n2Nune suite de variables aléatoires telle que, pour toutn2N,Xnsuit une loi binomialeB(n;p)avecn2Netp2]0;1[ et en appliquant la méthode.4.Déterminer alors s"il existe un effet de la dose de rayons X sur la variable
calculée en4.. Exercice 4. Plan en blocs complets.D"après G. Parreins.Techniques Statis- tiques : moyens rationnels de choix et de décision.Dunod technique, 1974. Nous voulons tester quatre types de carburateurs :A1,A2,A3etA4. Pour chaque type de carburateur nous disposons de six pièces qui sont montées successivement en parallèle sur quatre voitures que nous supposons avoir des caractéristiques par- faitement identiques. Le tableau ci-dessous indique pour chacun des essais la valeur d"un paramètre lié à la consommation :EssaiA 1A 2A 3A4121231820
224231921
325322825
420231915
534322429
61715149
3Frédéric BertrandMaster 1reAnnée - 2012/2013Nous décidonsde tenir comptede la possible influence de l"ordre de réalisation
des essais, c"est-à-dire du facteurEssai.1. Proposer une méthode statistique permettant d"étudier conjointement l"in-
fluence du facteurCarburateuret du facteurEssaisur la consommation. Énoncer le modèle et les hypothèses nécessaires au modèle que vous projetez d"utiliser. Ce modèle comporte-t-il des répétitions?2. Il y a-t-il des différences entre les carburateurs? Il y a-t-il des différences dues
au facteur bloc essais?3. Quelles sont les estimations des paramètres du modèle? Si nécessaire et si
possible, comparer les différents niveaux du facteurCarburateurainsi que les différents niveaux du facteurEssai. Exercice 5. Plan en blocs complets.D"après Husson et Pagès.Statistiques gé- nérales pour utilisateurs : Tome 2, Exercices et corrigés.Presses Universitaires deRennes, 2005.
Parmi trois variétés de blé, quelle est celle qui donne le meilleur rendement? Pour répondre à cette question, on met en culture ces trois variétés, sur trois parcelles distinctes. Chaque parcelle est divisée en trois sous-parcelles, et ainsi chaque variété est cultivée sur chaque parcelle. Les apports d"engrais azoté, de fongicide et d"insec- ticide sont les mêmes et sont considérés comme optimaux pour chaque variété. Les mesures ont été reportées dans le tableau ci-dessous.Le sol de chaque parcelle est censé être de même qualité mais on préfère le vérifier
en prenant en compte un effet parcelle dans le modèle d"analyse de la variance. Ce type d"effet est appelé " effet bloc ». On ne s"intéresse pas à cet effet, mais on le prend en compte dans l"analyse de la variance pour mieux mettre en évidence les éventuels effets des autres effets.Parcelle (bloc)VariétéRendement1A61,00
2A70,92
3A55,94
1L70,80
2L66,44
3L68,12
1M55,30
2M57,30
3M54,39
1. Pourquoi la prise en compte de l"effet bloc peut-elle être utile pour conclure
à un éventuel effet variété?4
Frédéric BertrandMaster 1reAnnée - 2012/20132. Y a-t-il un effet variété au niveau de confiance de 5%? On supprime l"effet
bloc de l"analyse.3. Pour quelle raison, en pratique, pourrait-on effectuer cette suppression? Cons-
truire le tableau d"analyse de la variance à un facteur (le facteur variété).4. Construire le test global de significativité de l"effet variété. Comment expliquez-
vous que le test devienne significatif? Exercice 6. Plan en blocs complets.Viennoiseries. Y. Dodge.Analyse de ré- gression appliquée.Éditions Dunod, 1999. Pendant la cuisson, les croissants absorbent la graisse en quantité variable. Nous avons relevé la quantité de graisse absorbée lors de la cuisson de six fournées de croissantes pour quatre types de graisse. Les mesures sont présentées dans le tableau ci-dessous.Fournée/Graisse1 2 3 4164 78 75 55
272 91 93 66
368 97 78 49
477 82 71 64
556 85 63 70
695 77 76 68
1. Quels sont les modèles que vous pouvez utiliser pour analyser ces données?
Pour chacun d"entre eux, détailler les hypothèses testées.2. Nous nous intéressons uniquement à ces quatre types de graisse. Par contre,
nous cherchons à savoir si il y a un effet des fournées en général sur la quantité de graisse utilisée. Pour cela, quel est donc le modèle à choisir parmi les trois précédents? Nous allons maintenant travailler avec le modèle que nous venons de choisir.3. Vérifier que les conditions d"application de l"ANOVA II sont vérifiées.
4. Construire, avec l"aide de MINITAB, le tableau d"analyse de la variance pour
ce modèle.5. La fournée a-t-elle un effet significatif sur la quantité de graisse absorbée?
Écrire explicitement les hypothèses nulle et alternative de votre test et justi- fiez votre réponse.6. La graisse a-t-elle un effet significatif sur la quantité de graisse absorbée?
Écrire explicitement les hypothèses nulle et alternative de votre test et justi- fiez votre réponse.7. Calculer2. Que concluez-vous?
8. Évaluer la puissance dans chacun des tests du tableau de l"ANOVA II.
9. Quelles sont les comparaisons multiples que vous pouvez réaliser? Réaliser-les
et analyser-les. 5Frédéric BertrandMaster 1reAnnée - 2012/2013Exercice 7. Deux facteurs croisés.D"après B. Falissard.Comprendre et utiliser
les statistiques dans les sciences de la vie.Masson, 2005. Nous testons l"influence de différents régimes alimentaires sur des rats de laboratoire. Le gain de poids des rats est désigné par la variablePoids, exprimée en grammes, les deux facteurs sont les variablesCalorieetV itamine. La variableCalorievaut1 si les rats n"ont pas suivi un régime hypercalorique et 2 s"ils ont suivi un tel
régime hypercalorique. La variableV itaminevaut 1 si les rats n"ont pas reçu decompléments vitaminés et 2 s"ils ont reçu de tels compléments.CalorieVitaminePoidsCalorieVitaminePoids
11841166
12621259
21872189
221032290
11661156
12841274
219221101
2210722116
11821179
12731274
21772195
229522112
11621189
12751274
21882191
22962292
1. Quels modèles d"analyse de la variance à deux facteurs pouvez-vous utiliser
pour étudier ces données? Nous décidons de retenir, pour répondre aux ques- tions suivantes, le modèle le plus complet parmi ceux dont il est possible de se servir. Rappeler les hypothèses associées au modèle.2. Procéder à l"étude à l"aide de SAS.
3. Quelles sont les estimations des paramètres du modèle?
4. Devons-nous réaliser des tests de comparaisons multiples? Si oui, pour quel(s)
facteur(s)? Le(s) faire. Exercice 8. Deux facteurs ou blocs croisés.Comparaison de l"évaluation de la résistance d"un même type de ciment. D"après H. Sahai et M. I. Ageel "The Analysis of Variance».6 Frédéric BertrandMaster 1reAnnée - 2012/2013Davies et Goldsmith1ont récolté les données d"une expérience dont le but était
d"étudier les différentes sources de variabilité possibles de la résistance d"un ciment fabriqué à Portland. On noteYla variable associée à la résistance du ciment.L"expérience s"est déroulée ainsi : plusieurs petits prélèvements d"un même type de
ciment ont été mélangés à de l"eau et travaillés par trois personnes différentes, les
" mélangeurs ». On a alors formé douze cubes à l"aide de chacune des préparationsdes "mélangeurs». Puis on a donné ces 36 cubes à trois personnes chargées d"évaluer
leur résistance, les " casseurs ». La répartition des 36 cubes entre ces " casseurs » a été faite de telle sorte que chaque " casseur » reçoive quatre cubes provenant de chacune des préparations des " mélangeurs » soit douze cubes au total. Tous les tests de résistance ont été faits sur la même machine. L"objectif principal de cette expérience était d"étudier et de quantifier l"importance de la variabilité dans les tests de résistance qui pouvait provenir des différences individuelles entre les" mélangeurs » et les " casseurs ». Les données ci-dessous, exprimées dans les unités
d"origine c"est-à-dire en livres par pouces carrés, ont été recopiées dans le tableau ci
dessous." Casseur » 1" Casseur » 2" Casseur » 3 " Mélangeur » 15280 55204340 44004160 51804760 58005020 62005320 4600
" Mélangeur » 24420 52805340 48804180 48005580 49004960 62004600 4480
" Mélangeur » 35360 61605720 47604460 49305680 55005620 55604680 5600
Partie I : deux facteurs fixes croisés
Dans l"expérience d"origine, on ne s"intéressait qu"aux différences ne pouvant être dues qu"à ces trois " mélangeurs » et à ces trois " casseurs ».1. Écrire le modèle d"analyse de la variance relatif à cette étude. On précisera
la nature des facteurs explicatifs ainsi que les hypothèses faites.2. Les hypothèses du modèle sont-elles vérifiées? Calculer les estimations de
tous les paramètres du modèle.3. Existe-t-il une interaction dans l"évaluation de la résistance du ciment entre
les " mélangeurs » et les " casseurs »?4. Existe-t-il des différences dans l"évaluation de la résistance dues aux " mélan-
geurs »?1. Davies, O.L. et Goldsmith, P.L. (Eds.),Statistical Methods in Research and Production, 4th
edition, Oliver and Boyd, Edinburgh, 1972.7Frédéric BertrandMaster 1reAnnée - 2012/20135. Existe-t-il des différences dans l"évaluation de la résistance dues aux " cas-
seurs »?6. Compte tenu de la nature des deux facteurs peut-on procéder à des compa-
raisons multiples? Il y a-t-il un facteur pour lequel cette procédure se justifie, si oui procéder aux tests correspondants.Partie II : deux facteur blocs croisés
On souhaite désormais que les résultats de cette expérience ait une portée plus gé- nérale que celle de la première partie : on ne restreint plus l"étude à cette population de " casseurs » et de " mélangeurs ».7. Écrire le modèle d"analyse de la variance relatif à cette étude. On précisera
la nature des facteurs explicatifs ainsi que les hypothèses faites.8. Les hypothèses du modèle sont-elles vérifiées? Calculer les estimations de
tous les paramètres du modèle.9. Existe-t-il une interaction dans l"évaluation de la résistance du ciment entre
les " mélangeurs » et les " casseurs »?10. Existe-t-il des différences dans l"évaluation de la résistance dues aux " mélan-
geurs »?11. Existe-t-il des différences dans l"évaluation de la résistance dues aux " cas-
seurs »? Exercice 9. Deux facteurs croisés.Activité d"une enzymeL"étude de l"activité d"une enzyme a été réalisée chez des sujets jeunes en fonction
de l"âge et du sexe.48 essais ont été réalisés dans des conditions similaires sur 48 individus distincts.
Leurs résultats, exprimés en unités arbitraires, ont été reproduits dans le tableau ci-dessous. 8 Frédéric BertrandMaster 1reAnnée - 2012/2013AgeSexeEnzymeAgeSexeEnzyme moins de 12 ansgarçon4,9plus de 12 ansgarçon2,1 moins de 12 ansgarçon2,9plus de 12 ansgarçon2,2 moins de 12 ansgarçon2,7plus de 12 ansgarçon1,1 moins de 12 ansgarçon3,9plus de 12 ansgarçon2,9 moins de 12 ansgarçon4,6plus de 12 ansgarçon5,0 moins de 12 ansgarçon3,3plus de 12 ansgarçon3,5 moins de 12 ansgarçon5,9plus de 12 ansgarçon2,4 moins de 12 ansgarçon4,8plus de 12 ansgarçon4,4 moins de 12 ansgarçon4,1plus de 12 ansgarçon2,1 moins de 12 ansgarçon3,5plus de 12 ansgarçon3,0 moins de 12 ansgarçon7,2plus de 12 ansgarçon3,9 moins de 12 ansgarçon6,1plus de 12 ansgarçon5,6 moins de 12 ansfille4,5plus de 12 ansfille2,4 moins de 12 ansfille6,9plus de 12 ansfille3,6 moins de 12 ansfille4,0plus de 12 ansfille4,8 moins de 12 ansfille5,4plus de 12 ansfille3,9 moins de 12 ansfille1,9plus de 12 ansfille5,5 moins de 12 ansfille3,6plus de 12 ansfille5,0 moins de 12 ansfille4,8plus de 12 ansfille6,8 moins de 12 ansfille3,3plus de 12 ansfille2,2 moins de 12 ansfille7,5plus de 12 ansfille3,1 moins de 12 ansfille5,8plus de 12 ansfille5,0 moins de 12 ansfille4,4plus de 12 ansfille4,1 moins de 12 ansfille6,0plus de 12 ansfille4,7Partie I
I.1.Écrire le modèle d"analyse de la variance relatif au modèle dont les résultats sont reproduits dans la suite de lapartie I. On précisera la nature des facteurs explicatifs ainsi que les hypothèses faites. I.2.Les hypothèses du modèle sont-elles vérifiées? Calculer les estimations de tous les paramètres du modèle. I.3.Procéder à l"étude du tableau de l"analyse de la variance. I.4.Compte tenu de la nature des facteurs peut-on procéder à des comparaisons multiples? Il y a-t-il un facteur pour lequel cette procédure se justifie, si oui procéder aux tests correspondants et interpréter les résultats.Partie II
II.1.Écrire le modèle d"analyse de la variance relatif au modèle dont les résultats sont reproduits ci-dessous. On précisera la nature des facteurs explicatifs ainsi que les hypothèses faites. II.2.Les hypothèses du modèle sont-elles vérifiées? Calculer les estimations de tous les paramètres du modèle. II.3.Procéder à l"étude du tableau de l"analyse de la variance.9Frédéric BertrandMaster 1reAnnée - 2012/2013II.4.Compte tenu de la nature des facteurs peut-on procéder à des comparaisons
multiples? Il y a-t-il un facteur pour lequel cette procédure se justifie, si oui procéder aux tests correspondants et interpréter les résultats. II.5.En comparant les résultats obtenus dans cette seconde partie avec ceux de la première partie, que constatez-vous? Exercice 10. Deux facteurs croisés.Quatre modèles de machines à écrire. D"aprèsFrançois Husson et Jérôme PagèsStatistiques générales pour utilisateurs, éditions
PUR. Une entreprise cherche à tester quatre modèles de machines à écrire. Pour faire ce test, elle demande à cinq secrétaires professionnelles de taper un texte pendant 5 minutes. À la fin du test, on compte le nombre moyen de mots tapés en une minute.On répète l"expérience le lendemain.
Les résultats (nombre moyen de mots par minute) sont présentés dans le tableau au verso.SecrétairesMachines à écrire1 2 3 4 5
133 31 34 34 31
36 31 36 33 31
232 37 40 33 35
35 35 36 36 36
337 35 34 31 37
39 35 37 35 40
429 31 33 31 33
31 33 34 27 33
Soit le modèle :
Y i;j;k=+i+j+ i;j+i;j;k aveci= 1;2;3;4,j= 1;2;3;4;5etk= 1;2et oùcorrespond à l"influence de la machine à écrire,l"influence de la secrétaire et l"interaction entre la machinei et la secrétairej.1. Décrire le modèle, et ses conditions d"utilisation, qui permet de tester les trois
hypothèses nulles suivantes : (i) Que cherche-t-on à tester avec les deux hypothèses suivantes? H0:1=2=3=4
contre H1:les valeurs desine sont pas toutes égales,i= 1;2;3;4:
(ii) Que cherche-t-on à tester avec les deux hypothèses suivantes? H0:1=2=3=4=5
contre H1:les valeurs desjne sont pas toutes égales,j= 1;2;3;4;5:
10Frédéric BertrandMaster 1reAnnée - 2012/2013(iii) Que cherche-t-on à tester avec les deux hypothèses suivantes?
H 0: 1;1= 1;2== 1;5= 2;1== 4;5 contre H1:les valeurs des
i;jne sont pas toutes égales,i= 1;2;3;4etj= 1;2;3;4;5:2. Décrire le modèle, et ses conditions d"utilisation, qui permet de tester les trois
hypothèses nulles suivantes : (i) Que cherche-t-on à tester avec les deux hypothèses suivantes? H0:2A= 0
contre H1:2A6= 0:
(ii) Que cherche-t-on à tester avec les deux hypothèses suivantes? H0:2B= 0
contre H1:2B6= 0:
(iii) Que cherche-t-on à tester avec les deux hypothèses suivantes? H0:2AB= 0
contre H1:2AB6= 0:
3. Décrire le modèle, et ses conditions d"utilisation, qui permet de tester les trois
hypothèses nulles suivantes : (i) Que cherche-t-on à tester avec les deux hypothèses suivantes? H0:1=2=3=4
contre H1:les valeurs desine sont pas toutes égales,i= 1;2;3;4:
(ii) Que cherche-t-on à tester avec les deux hypothèses suivantes? H0:2B= 0
contre H1:2B6= 0:
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