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TD 06 : les peptides

Exercice 01

Soit le peptide suivant : NH2-Val-Gly-Arg-Tyr-Lys-Asp-Glu-COOH Les phi des acides aminés constitutifs de cet heptapeptide sont respectivement les suivants : 5.97, 5.97, 10.76 ; 5.65 ; 9.74 ; 2.98 ; 3.22. Sa migration électrophorétique à ph 6 sera cathodique, anodique ou nulle ? justifier ta réponse.

Exercice 02

: Arg 1, Ala 1 ; Val 1 ; Leu 1 ; Phe1 ; Tyr1.

Ala et Tyr.

Le peptide P1 constitué de Phe et Arg.

Le peptide P2 constitué de Leu et Val et un peptide P3 constitué de Phe, Leu et Arg.

En déduire la structure de ce peptide.

Exercice 03

Soit un peptide dont la composition en acides aminés est la suivante : 1Ala, 1Gly,

2Arg, 1Val, 1Phe, 1Trp.

- La réaction avec le DNFB donne un DNB-Gly. - La carboxypeptidase B libère une Arg. - La trypsine hydrolyse ce peptide en deux fragments ayant respectivement la composition globale suivante : - Fragment1 : 1Ala, 1Gly, 1Arg, 1Phe. - Fragment2 : Val, 1Arg, 1Trp. acides aminés suivants : 1 Ala, 1 Arg, 1Trp, 1Val.

Etablissez la structure primaire de ce peptide.

TD 6 : Les peptides (suite)

Exercice 04

On donne les peptides suivants : Lys-Ala-His-Gly-Met et Trp-Leu-Asp-Cys. - Ecrire la formule développée de ces peptides. - Etudier la variation de leur charge nette en fonction de pH et déterminer leur pH isoélectrique. On utilisera les valeurs suivantes pour pKa des différentes fonctions ionisables : ǹ-COOH ȕȖ-COOH Į-İ-NH2 ; imidazole ; thiol

3 4.5 8.5 10.5 6.5 10

Exercice 05

Après hydrolyse par la chymotrypsine de la protéine " 0,62 » de la laine, on a obtenu un oligopeptide P dont la composition en acides aminés : Thr1, Ser2, Pro1, partir de P, les PTH de Ser, Ser, Thr et Val. La Thermolysine, enzyme protéolytique,

Pର , duquel on

Quelle est la séquence de P ?

Exercice 06

Coli, on a notamment isolé un oligopeptide P, dont la composition en acides aminés est : Lys1, Asx1, Thr1, Glx1, Val1, Leu1, Ile1, Phe1. La charge nette de P est à pH 6.5

9DO 4XDQG 3 HVW K\GURO\Vp SDU OD FK\PRWU\SVLQH RQ REWLHQW QRWDPPHQW XQ

ROLJRSHSWLGH30 dont la composition brute en acides aminés est Asx1, Val1, Leu1, Ile1.

Quelle est la séquence de P ?

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