Offre de thèse

͞Control of gut development and physiology by cytokine signalling" Poste à pouvoir à compter du 1er Septembre 2021

Localisation Paris 5e arr.

Ref : 2021-EuReCa-HER

Structure d'accueil

Le Centre de Recherche de l'Institut Curie

L'Institut Curie est un acteur majeur de la recherche et de la lutte contre le cancer. Il est constitué d'un hôpital et d'un

Centre de Recherche de plus de 1000 collaborateurs avec une forte représentativité internationale.

L'objectif du Centre de Recherche de l'institut Curie est de dĠǀelopper la recherche fondamentale et d'utiliser les

connaissances produites pour améliorer le diagnostic, le pronostic, la thérapeutique des cancers dans le cadre du

continuum entre la recherche fondamentale et l'innoǀation au serǀice du malade.

Directeur(s) de thèse et équipe

- Directeur(s) de thèse Pedro Hernandez - Équipe de recherche Développement et homéostasie des tissus muqueux - Département de recherche U 934 - Génétique et biologie du développement

Description du sujet de thèse

Dans notre groupe, nous travaillons à l'intersection de l'immunologie et de la biologie du développement. Notre objectif

principal est de comprendre comment les signaux environnementaux interagissent avec les réseaux génétiques de l'hôte

pour réguler le développement et la physiologie des organes. Nous nous intéressons particulièrement à l'intestin, qui se

forme initialement sans influence majeure de facteurs extrinsèques, mais qui se développe ensuite en interaction avec

plusieurs microorganismes commensales et nutriments alimentaires. Nous étudions comment la réciprocité entre le

système immunitaire et les signaux environnementaux régule le développement de l'intestin et la fonction épithéliale. Pour

étudier ces questions, nous exploitons les avantages du modèle du poisson-zèbre tels que le développement ex utero et

rapide, la transparence, une progéniture nombreuse et une manipulation génétique et environnementale simple. Nous

combinons l'imagerie en temps réel, la cytométrie en flux et la transcriptomique globale et unicellulaire avec des modèles

qui induisent des stress au niveau des muqueuses, y compris des défis pathogènes.

Résumé du projet : les cytokines sont de petites protéines sécrétées, caractérisées à l'origine comme des modulateurs des

réponses de défense provenant des leucocytes. Nous avons récemment découvert que les cellules épithéliales intestinales

des larves de poisson-zèbre expressent plusieurs cytokines avant que les lymphocytes expresseurs de cytokines ne se

développent et ne colonisent cet organe. Il a été pensé que ces cytokines étaient produites uniquement par les leucocytes

et nous avons constaté que la perturbation de leur signalisation provoque une altération profonde du développement

intestinal. Nous formulons l'hypothèse que l'action orchestrée des cytokines dans l'intestin est essentielle pour son

développement et l'établissement d'une structure épithéliale fonctionnelle. Nous proposons un projet de recherche visant

à découvrir comment la signalisation des cytokines contrôle le développement et l'homéostasie intestinale. Nous cherchons

également à déterminer la relation entre le microbiote et la fonction des cytokines dans le contrôle du développement et

de la physiologie intestinale. Ce projet apportera des connaissances fondamentales sur la façon par laquelle la

communication intercellulaire médiée par les signaux immunitaires contrôle l'organogenèse et maintient l'homéostasie des

tissus Aspects internationaux, interdisciplinaires, intersectoriels du projet

Nous exploiterons et renforcerons nos collaborations locales et internationales en cours : Jean-Pierre Levraud, Institut des

neurosciences, Paris-Saclay, France (immunité du poisson-zèbre) ; Jean-Marc Ghigo, Institut Pasteur, Paris, France

(microbiote intestinal) ; Carmen Feijoo, Université Andres Bello, Santiago, Chili (inflammation intestinale induite par le

régime alimentaire chez le poisson zèbre) ; Eduardo Villablanca, Karolinska Institutet, Suède (immunologie intestinale de la

souris et du poisson zèbre). L'étudiant aura la possibilité de faire des séjours de recherche dans ces laboratoires. De plus,

les lignées de poissons zèbres qui seront générées seront utilisées pour le screening à haut volume de molécules modulant

l'inflammation intestinale (avec E. Villablanca). Enfin, ce projet combine les approches conceptuelles et techniques utilisées

en biologie du développement, l'immunologie et la bio-informatique.

Publications récentes

1. Coronado M, Solis CJ, HERNANDEZ PP* and Feijoo CG. Soybean Meal-Induced Intestinal Inflammation in

Zebrafish Is T Cell-Dependent and Has a Th17 Cytokine Profile. Front Immunol. 2019 Apr 2; 10:610. doi:

10.3389/fimmu.2019.00610. PMID: 31001250; PMCID: PMC6454071. (*) Corresponding author

2. Gronke K, HERNANDEZ PP, Zimmermann J, Klose C, Kofoed-Branzk M, Guendel-Rojas F, Witkowski M,

Tizian C, Amann L, Schumacher F, Glatt H, Triantafyllopoulou A, and Diefenbach A. Interleukin-22 protects

intestinal stem cells against genotoxic stress. Nature. 2019 Feb; 566(7743):249-253. doi: 10.1038/s41586-

019-0899-7. Epub 2019 Jan 30. PMID: 30700914; PMCID: PMC6420091. (*) Equal contribution.

3. HERNANDEZ PP, Strzelecka P, Athanasiadis E, Hall D, Robalo AF, Collins AM, Boudinot P, Levraud JP,

Cvejic* A. Single-cell transcriptional analysis reveals ILC-like cells in zebrafish. Sci Immunol. 2018 Nov 16;

3(29):eaau5265. doi: 10.1126/sciimmunol.aau5265. PMID: 30446505; PMCID: PMC6258902 (*)

Corresponding author.

4. HERNANDEZ PP, Mahlakoiv T, Nguyen N, Guendel F, Ryffel B, Hoelscher C, Dumoutier L, Renauld JC,

Staeheli P and Diefenbach A. Interferon-ʄ and interleukin 22 act synergistically for the induction of

interferon-stimulated genes and control of rotavirus infection. Nat Immunol. 2015 Jul; 16(7):698-707. doi:

10.1038/ni.3180. Epub 2015 May 25. PMID: 26006013; PMCID: PMC4589158. Featured Paper of the Month

of July, 2015 by the Society for Mucosal Immunology. Research highlight in Nature Reviews Immunology,

15, 402-403 (2015)

5. Mahlakoiv T, HERNANDEZ PP, Diefenbach A and Staeheli P. Leukocyte-derived IFN-a/b and epithelial

IFN-l constitute a compartmentalized mucosal defense system that restricts enteric virus infections. PLoS

Pathog. 2015 Apr 7; 11(4):e1004782. doi: 10.1371/journal.ppat.1004782. PMID: 25849543; PMCID: PMC4388470.. (*) Equal contribution. Recommended in The F1000Prime Faculty

Profil recherché

- Les candidat(e)s doivent être fortement motivé(e)s pour étudier les phénomènes biologiques dans un contexte in

vivo, et doivent faire preuve d'une solide capacité de réflexion indépendante et créative ainsi que de travail en

équipe.

- Une formation et un intérêt marqué pour la biologie du développement et/ou l'immunologie sont fortement

recommandés. Intérêt pour la biologie comparative utilisant différents modèles animaux, ainsi que les applications

translationnelles à l'homme sont souhaitée. - Des connaissances en analyse bioinformatique sont un plus mais ne sont pas obligatoires.

- Expérience en biologie moléculaire, la RT-qPCR, la microscopie et la cytométrie en flux sont également des atouts.

Toutes nos opportunités sont ouvertes à des personnes en situation de handicap.

Informations sur le contrat

Type de contrat : CFR (Contrat de Formation par le Recherche)

Durée du contrat : 3 ans

Temps de travail : Temps complet

Avantages : Restauration collectiǀe, prise en charge du titre de transport ă 70й, mutuelle d'entreprise

Contact

Merci de postuler en suivant le lien https://eureca.curie.fr/application/login.php

Date de parution de l'offre : 10 Décembre 2020

Date limite des candidatures : 14 Janvier 2021

Institut Curie is an inclusive, equal opportunity employer and is dedicated to the highest standards of research integrity.quotesdbs_dbs5.pdfusesText_10

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