Mesure de l’activité enzymatique
Il est difficile de mesurer la quantité d’enzyme en unités de masse ou de concentration molaire (quantité trop faible et problème de purification); l’activité enzymatique est défini en terme de vitesse de réaction (la V étant directement proportionnelle à la quantité d’enzyme) 2
EXERCICES D’ENZYMOLOGIE
Pour calculer une activité molaire, il faut : 1) Etre en conditions optimales de mesure de la vitesse de réaction, c'est-à-dire, en conditions saturantes de substrat ([S]>>K M) où V=V max 2) Avoir une solution pure d' enzyme Aide 2 : Il faut connaître la Vmax pour calculer l'activité molaire
3 Cinétique enzymatique - ESI
Il est difficile de mesurer la quantité d’enzyme en unités de masse ou de concentration molaire; l’activité enzymatique est défini en terme de vitesse de réaction L’unité international (I U ) est le montant d’enzyme requis pour convertir 1-µmol de substrat en produit dans 1 min à
Les enzymes - Remedeorg
C L’activité spécifi que est exprimée en U/mole d’enzyme D L’activité spécifi que moléculaire augmente avec le degré de pureté d’une préparation d’enzyme E Dans une réaction dont le k catalytique (kcat) est 100 s-1, une mole d’enzyme transforme 100 moles de substrat par seconde 61 On a purifi é une enzyme à partir
TP 8 Détermination de l’activité spécifique d’une enzyme
Une nanokatal mesure l’activité de l’enzyme qui a libérée une nanomole de produit ou qui transforme une nanomole de substrat en une seconde à 30°C dans les conditions optimales d’action L’activité spécifique est rapportée à 1mg d’enzyme mesuré par un dosage de protéine II Le travail de cette séquence de TP
Méthodes de mesure des activités enzymatiques
d’enzyme qui catalyse la transformation d’une micromole de substrat par minute ; 4280_ Page 926 Jeudi, 18 juillet 2013 3:07 15 •le katal (kat) , cohérent, correspond à la quantité d’enzyme qui catalyse la trans-
Les Enzymes
C’est l’activité de l’échantillon divisée par la masse de protéine qui permet cette activité ii Exprimée en U / mg ; cat / mg iii Elle représente un critère de pureté 5 Activité catalytique molaire : ACM i C’est l’activité catalytique de solution divisée par la quantité d’enzymes ii = nombre de moles de substrat
Activité 1 : Mise en évidence de la spécificité de substrat
les scientifiques ont élaboré des modèles moléculaires de l’enzyme seule ou de l’enzyme avec son substrat ce qui a permis de comprendre cette spécificité de substrat On cherche à comprendre, par visualisation de molécules en 3D, pourquoi l’amylase modifiée a une activité très faible Document 1 : Mode d’action des enzymes
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enzymatique
DR AKSAS
1Il
2Cette mesure consiste à évaluer la
3L'actiǀitĠ d'une enzyme se mesure
1.d'un
d'apparition d'un3.d'utilisation d'un
4Méthodes de mesure
2 Méthode en point final ou " à deux points »Méthodes cinétiques:
1. 5 Si expérimentales[S]0 et[S]0 la d'enzyme C'est doser d'enzyme 6Conditions opératoires
et maximale a)0et déterminer contient. b) optimale c) [S]( activateurs 7Le substrat
Le Pour Pour Il doitMais Un de on exige que S > 10 Km. 8Température
En , CSFBC(société
C 9La durée de la mesure
AE = Vi en [ ] saturante de substrat
10 10Le Témoin
Dans les méthodes " 2 points »
On Ce que .Dans les méthodes cinétiques
On 11Les unités enzymatiques
katalquantité seconde trop-Launité
internationalequi catalyse minute 6012
Les unités enzymatiques
Nombre
AEMNombre
ASElle enzymatique
13Les unités enzymatiques
Le=
/ Activité enzymatique totale de départ (x Le=
spécifique de départ 14 1 manuelle 1. durée, 2.son 3.Į .15
Méthode en point final ou à " 2 points »
Ladoit
Le lorsque nécessaire¾soit
¾soit
zone0en¾soit.
16Méthode en point final ou à " 2 points »
Faire Ce (Exemple transformer 17Méthode en point final ou à " 2 points »
Exemple:
LetĮ-;
-30. -Dinitro 18 ALATMéthode en point final ou à " 2 points »
C solution 19 2Consiste de
La spécifiqueUV visible
tempsplus 20Cinétique enzymatique en Ultra
LeNAD/NADH NADP/NADPH
employé LaUV NAD+/NADHqui
sont Ces Cette 21Méthodes cinétiques
Dans continu, fixée La réactif) stabilise EllePpermet
22Cinétique enzymatique en Ultra
NAD considérés(réactionAH2 + NAD+ A + NADH,H
AH2 + NADP+ A + NADPH,H
[NAD+ ] > 10 NAD 23Cinétique enzymatique en
NADH NAD+, Si réduction NAD+,la; oxydation deDO. LeNADPHİ -cm- 24
Cinétique enzymatique en
NADH-cm-
NAD+ 25AEMesure
de 340nmAE diminution
de A340nm LDH NADн et NADH2 prĠsentent un pic d'absorbtion ( surtout NAD+) a 260 nm alors on mesure électivement Le NADH2 a 26A 340 nm ( UV) Si on mesure :
27Cinétique enzymatique en Ultra Violet
Condition cte
permet Dans tampon àNADH,H .
Puispyruvate
On La droite 28Lactate déshydrogénase
(EC 1.1.1.27)Lactate = substrat
Pyruvate = produit
NAD+/NADH = cofacteur
29Cinétique enzymatique en
OnDO/min
déclenchée, Les OnT E 3 UI.l-
VTet VE en3
30Cinétique enzymatique en
DO = İ
DO1 İ 1 1=1 İ
DO2 İ 2 2=2 İ
2-1=DO2 İ DO1 İ
0 31Cinétique enzymatique en
= x x 6A 340 nm İNADH,H + = -. cm-.l.
AE en 32VE VT
Réactions enzymatiques couplées
déshydrogénase à NAD+ ou NADP+ et que ni S et ni P ne possèdent de propriétés spectrales, alors on couple la première R à une deuxième, catalysée par une déshydrogénase dont P est le substrat. S P PH2 33E1